Protein–RNA interactions for Protein: P49368

CCT3, T-complex protein 1 subunit gamma, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT3P49368 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CCT3P49368 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCT3P49368 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCT3P49368 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCT3P49368 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCT3P49368 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCT3P49368 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCT3P49368 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCT3P49368 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCT3P49368 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCT3P49368 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCT3P49368 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCT3P49368 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCT3P49368 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCT3P49368 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCT3P49368 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCT3P49368 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCT3P49368 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCT3P49368 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCT3P49368 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCT3P49368 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCT3P49368 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCT3P49368 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCT3P49368 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCT3P49368 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCT3P49368 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCT3P49368 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCT3P49368 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCT3P49368 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCT3P49368 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCT3P49368 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCT3P49368 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCT3P49368 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCT3P49368 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCT3P49368 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCT3P49368 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCT3P49368 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCT3P49368 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCT3P49368 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCT3P49368 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCT3P49368 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCT3P49368 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCT3P49368 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCT3P49368 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CCT3P49368 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCT3P49368 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCT3P49368 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCT3P49368 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCT3P49368 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCT3P49368 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CCT3P49368 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCT3P49368 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCT3P49368 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCT3P49368 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CCT3P49368 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCT3P49368 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CCT3P49368 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCT3P49368 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCT3P49368 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCT3P49368 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCT3P49368 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCT3P49368 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCT3P49368 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCT3P49368 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCT3P49368 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCT3P49368 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCT3P49368 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CCT3P49368 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCT3P49368 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCT3P49368 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCT3P49368 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCT3P49368 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCT3P49368 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CCT3P49368 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCT3P49368 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCT3P49368 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CCT3P49368 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCT3P49368 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCT3P49368 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCT3P49368 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCT3P49368 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCT3P49368 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCT3P49368 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCT3P49368 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCT3P49368 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCT3P49368 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCT3P49368 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCT3P49368 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCT3P49368 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCT3P49368 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCT3P49368 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCT3P49368 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCT3P49368 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCT3P49368 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCT3P49368 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCT3P49368 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCT3P49368 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCT3P49368 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCT3P49368 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCT3P49368 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms