Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CDK8P49336 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
CDK8P49336 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CDK8P49336 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CDK8P49336 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CDK8P49336 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CDK8P49336 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CDK8P49336 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CDK8P49336 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CDK8P49336 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CDK8P49336 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CDK8P49336 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CDK8P49336 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CDK8P49336 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CDK8P49336 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CDK8P49336 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
CDK8P49336 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CDK8P49336 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
CDK8P49336 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CDK8P49336 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CDK8P49336 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
CDK8P49336 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CDK8P49336 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CDK8P49336 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CDK8P49336 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
CDK8P49336 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
CDK8P49336 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CDK8P49336 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CDK8P49336 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CDK8P49336 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CDK8P49336 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CDK8P49336 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
CDK8P49336 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CDK8P49336 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CDK8P49336 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CDK8P49336 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CDK8P49336 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CDK8P49336 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CDK8P49336 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CDK8P49336 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
CDK8P49336 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CDK8P49336 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
CDK8P49336 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CDK8P49336 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CDK8P49336 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CDK8P49336 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CDK8P49336 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CDK8P49336 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
CDK8P49336 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CDK8P49336 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CDK8P49336 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CDK8P49336 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CDK8P49336 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CDK8P49336 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
CDK8P49336 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CDK8P49336 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
CDK8P49336 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CDK8P49336 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CDK8P49336 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CDK8P49336 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CDK8P49336 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CDK8P49336 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CDK8P49336 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CDK8P49336 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CDK8P49336 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CDK8P49336 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CDK8P49336 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
CDK8P49336 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CDK8P49336 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CDK8P49336 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CDK8P49336 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CDK8P49336 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CDK8P49336 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
CDK8P49336 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
CDK8P49336 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CDK8P49336 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CDK8P49336 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CDK8P49336 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CDK8P49336 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CDK8P49336 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CDK8P49336 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CDK8P49336 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CDK8P49336 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CDK8P49336 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
CDK8P49336 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
CDK8P49336 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CDK8P49336 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CDK8P49336 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CDK8P49336 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
CDK8P49336 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CDK8P49336 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CDK8P49336 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CDK8P49336 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CDK8P49336 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
CDK8P49336 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CDK8P49336 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CDK8P49336 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CDK8P49336 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CDK8P49336 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
CDK8P49336 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms