Protein–RNA interactions for Protein: P49335

POU3F4, POU domain, class 3, transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU3F4P49335 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POU3F4P49335 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
POU3F4P49335 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POU3F4P49335 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POU3F4P49335 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POU3F4P49335 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
POU3F4P49335 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POU3F4P49335 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POU3F4P49335 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
POU3F4P49335 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POU3F4P49335 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POU3F4P49335 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POU3F4P49335 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POU3F4P49335 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POU3F4P49335 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POU3F4P49335 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POU3F4P49335 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POU3F4P49335 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POU3F4P49335 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POU3F4P49335 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POU3F4P49335 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POU3F4P49335 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POU3F4P49335 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POU3F4P49335 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POU3F4P49335 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POU3F4P49335 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POU3F4P49335 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POU3F4P49335 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POU3F4P49335 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POU3F4P49335 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
POU3F4P49335 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POU3F4P49335 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POU3F4P49335 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POU3F4P49335 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POU3F4P49335 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POU3F4P49335 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POU3F4P49335 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POU3F4P49335 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POU3F4P49335 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POU3F4P49335 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
POU3F4P49335 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POU3F4P49335 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POU3F4P49335 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
POU3F4P49335 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POU3F4P49335 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
POU3F4P49335 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
POU3F4P49335 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
POU3F4P49335 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POU3F4P49335 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POU3F4P49335 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POU3F4P49335 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
POU3F4P49335 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POU3F4P49335 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POU3F4P49335 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POU3F4P49335 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POU3F4P49335 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POU3F4P49335 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POU3F4P49335 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POU3F4P49335 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POU3F4P49335 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POU3F4P49335 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POU3F4P49335 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POU3F4P49335 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POU3F4P49335 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POU3F4P49335 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POU3F4P49335 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POU3F4P49335 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
POU3F4P49335 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POU3F4P49335 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POU3F4P49335 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
POU3F4P49335 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
POU3F4P49335 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
POU3F4P49335 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
POU3F4P49335 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POU3F4P49335 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POU3F4P49335 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POU3F4P49335 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POU3F4P49335 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POU3F4P49335 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
POU3F4P49335 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POU3F4P49335 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.31■■□□□ 1
POU3F4P49335 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
POU3F4P49335 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POU3F4P49335 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POU3F4P49335 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
POU3F4P49335 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
POU3F4P49335 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
POU3F4P49335 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POU3F4P49335 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
POU3F4P49335 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
POU3F4P49335 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POU3F4P49335 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POU3F4P49335 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POU3F4P49335 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
POU3F4P49335 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POU3F4P49335 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POU3F4P49335 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POU3F4P49335 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POU3F4P49335 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POU3F4P49335 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms