Protein–RNA interactions for Protein: P46926

GNPDA1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA1P46926 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GNPDA1P46926 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GNPDA1P46926 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GNPDA1P46926 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
GNPDA1P46926 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GNPDA1P46926 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GNPDA1P46926 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GNPDA1P46926 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
GNPDA1P46926 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GNPDA1P46926 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GNPDA1P46926 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
GNPDA1P46926 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GNPDA1P46926 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
GNPDA1P46926 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GNPDA1P46926 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GNPDA1P46926 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GNPDA1P46926 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GNPDA1P46926 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GNPDA1P46926 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GNPDA1P46926 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GNPDA1P46926 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GNPDA1P46926 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GNPDA1P46926 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GNPDA1P46926 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GNPDA1P46926 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GNPDA1P46926 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GNPDA1P46926 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
GNPDA1P46926 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GNPDA1P46926 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GNPDA1P46926 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GNPDA1P46926 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GNPDA1P46926 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GNPDA1P46926 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GNPDA1P46926 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GNPDA1P46926 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GNPDA1P46926 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GNPDA1P46926 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GNPDA1P46926 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GNPDA1P46926 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GNPDA1P46926 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GNPDA1P46926 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
GNPDA1P46926 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
GNPDA1P46926 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GNPDA1P46926 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GNPDA1P46926 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GNPDA1P46926 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GNPDA1P46926 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GNPDA1P46926 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GNPDA1P46926 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GNPDA1P46926 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GNPDA1P46926 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GNPDA1P46926 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GNPDA1P46926 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GNPDA1P46926 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GNPDA1P46926 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GNPDA1P46926 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GNPDA1P46926 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GNPDA1P46926 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
GNPDA1P46926 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GNPDA1P46926 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GNPDA1P46926 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GNPDA1P46926 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GNPDA1P46926 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GNPDA1P46926 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GNPDA1P46926 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GNPDA1P46926 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GNPDA1P46926 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GNPDA1P46926 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GNPDA1P46926 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GNPDA1P46926 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GNPDA1P46926 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
GNPDA1P46926 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GNPDA1P46926 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GNPDA1P46926 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GNPDA1P46926 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GNPDA1P46926 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GNPDA1P46926 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GNPDA1P46926 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GNPDA1P46926 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GNPDA1P46926 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GNPDA1P46926 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GNPDA1P46926 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GNPDA1P46926 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GNPDA1P46926 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GNPDA1P46926 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GNPDA1P46926 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GNPDA1P46926 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GNPDA1P46926 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GNPDA1P46926 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
GNPDA1P46926 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GNPDA1P46926 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GNPDA1P46926 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GNPDA1P46926 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
GNPDA1P46926 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GNPDA1P46926 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GNPDA1P46926 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GNPDA1P46926 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GNPDA1P46926 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GNPDA1P46926 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GNPDA1P46926 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms