Protein–RNA interactions for Protein: P45844

ABCG1, ATP-binding cassette sub-family G member 1, humanhuman

Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCG1P45844 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ABCG1P45844 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ABCG1P45844 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ABCG1P45844 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ABCG1P45844 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ABCG1P45844 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ABCG1P45844 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ABCG1P45844 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ABCG1P45844 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
ABCG1P45844 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ABCG1P45844 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ABCG1P45844 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ABCG1P45844 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ABCG1P45844 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ABCG1P45844 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
ABCG1P45844 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ABCG1P45844 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ABCG1P45844 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ABCG1P45844 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ABCG1P45844 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ABCG1P45844 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ABCG1P45844 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ABCG1P45844 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ABCG1P45844 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ABCG1P45844 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ABCG1P45844 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ABCG1P45844 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ABCG1P45844 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ABCG1P45844 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ABCG1P45844 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ABCG1P45844 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ABCG1P45844 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ABCG1P45844 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ABCG1P45844 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ABCG1P45844 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ABCG1P45844 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ABCG1P45844 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ABCG1P45844 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ABCG1P45844 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ABCG1P45844 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ABCG1P45844 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ABCG1P45844 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ABCG1P45844 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ABCG1P45844 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ABCG1P45844 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ABCG1P45844 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ABCG1P45844 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ABCG1P45844 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ABCG1P45844 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ABCG1P45844 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ABCG1P45844 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ABCG1P45844 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ABCG1P45844 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ABCG1P45844 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ABCG1P45844 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ABCG1P45844 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ABCG1P45844 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ABCG1P45844 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ABCG1P45844 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ABCG1P45844 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ABCG1P45844 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ABCG1P45844 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ABCG1P45844 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ABCG1P45844 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ABCG1P45844 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ABCG1P45844 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ABCG1P45844 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ABCG1P45844 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ABCG1P45844 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ABCG1P45844 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ABCG1P45844 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ABCG1P45844 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ABCG1P45844 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ABCG1P45844 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ABCG1P45844 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ABCG1P45844 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ABCG1P45844 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ABCG1P45844 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ABCG1P45844 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ABCG1P45844 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ABCG1P45844 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ABCG1P45844 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ABCG1P45844 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ABCG1P45844 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ABCG1P45844 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ABCG1P45844 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ABCG1P45844 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ABCG1P45844 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ABCG1P45844 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ABCG1P45844 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ABCG1P45844 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ABCG1P45844 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ABCG1P45844 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ABCG1P45844 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ABCG1P45844 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ABCG1P45844 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ABCG1P45844 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ABCG1P45844 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ABCG1P45844 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ABCG1P45844 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.1 ms