Protein–RNA interactions for Protein: P43355

MAGEA1, Melanoma-associated antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGEA1P43355 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MAGEA1P43355 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MAGEA1P43355 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MAGEA1P43355 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MAGEA1P43355 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MAGEA1P43355 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
MAGEA1P43355 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MAGEA1P43355 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MAGEA1P43355 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
MAGEA1P43355 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MAGEA1P43355 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MAGEA1P43355 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MAGEA1P43355 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MAGEA1P43355 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MAGEA1P43355 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MAGEA1P43355 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
MAGEA1P43355 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MAGEA1P43355 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MAGEA1P43355 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MAGEA1P43355 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MAGEA1P43355 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MAGEA1P43355 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MAGEA1P43355 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MAGEA1P43355 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
MAGEA1P43355 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MAGEA1P43355 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MAGEA1P43355 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MAGEA1P43355 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MAGEA1P43355 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MAGEA1P43355 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MAGEA1P43355 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MAGEA1P43355 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MAGEA1P43355 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
MAGEA1P43355 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MAGEA1P43355 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MAGEA1P43355 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MAGEA1P43355 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MAGEA1P43355 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MAGEA1P43355 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MAGEA1P43355 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MAGEA1P43355 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
MAGEA1P43355 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
MAGEA1P43355 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
MAGEA1P43355 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
MAGEA1P43355 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MAGEA1P43355 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MAGEA1P43355 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MAGEA1P43355 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MAGEA1P43355 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MAGEA1P43355 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MAGEA1P43355 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MAGEA1P43355 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MAGEA1P43355 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MAGEA1P43355 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MAGEA1P43355 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MAGEA1P43355 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
MAGEA1P43355 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
MAGEA1P43355 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MAGEA1P43355 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MAGEA1P43355 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MAGEA1P43355 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MAGEA1P43355 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
MAGEA1P43355 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MAGEA1P43355 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MAGEA1P43355 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
MAGEA1P43355 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
MAGEA1P43355 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
MAGEA1P43355 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MAGEA1P43355 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MAGEA1P43355 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MAGEA1P43355 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MAGEA1P43355 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
MAGEA1P43355 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
MAGEA1P43355 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MAGEA1P43355 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MAGEA1P43355 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MAGEA1P43355 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
MAGEA1P43355 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MAGEA1P43355 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MAGEA1P43355 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MAGEA1P43355 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MAGEA1P43355 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MAGEA1P43355 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MAGEA1P43355 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MAGEA1P43355 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MAGEA1P43355 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MAGEA1P43355 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MAGEA1P43355 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MAGEA1P43355 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MAGEA1P43355 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MAGEA1P43355 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MAGEA1P43355 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MAGEA1P43355 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
MAGEA1P43355 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MAGEA1P43355 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MAGEA1P43355 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MAGEA1P43355 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MAGEA1P43355 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MAGEA1P43355 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MAGEA1P43355 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.9 ms