Protein–RNA interactions for Protein: P43234

CTSO, Cathepsin O, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSOP43234 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTSOP43234 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTSOP43234 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTSOP43234 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTSOP43234 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTSOP43234 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTSOP43234 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CTSOP43234 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CTSOP43234 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CTSOP43234 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTSOP43234 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTSOP43234 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTSOP43234 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTSOP43234 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTSOP43234 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CTSOP43234 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTSOP43234 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTSOP43234 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTSOP43234 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CTSOP43234 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CTSOP43234 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CTSOP43234 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTSOP43234 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTSOP43234 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTSOP43234 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CTSOP43234 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTSOP43234 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTSOP43234 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTSOP43234 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTSOP43234 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTSOP43234 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTSOP43234 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTSOP43234 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTSOP43234 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTSOP43234 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTSOP43234 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CTSOP43234 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CTSOP43234 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CTSOP43234 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CTSOP43234 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTSOP43234 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTSOP43234 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTSOP43234 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTSOP43234 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTSOP43234 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CTSOP43234 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CTSOP43234 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTSOP43234 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTSOP43234 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTSOP43234 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTSOP43234 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTSOP43234 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTSOP43234 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTSOP43234 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTSOP43234 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTSOP43234 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTSOP43234 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CTSOP43234 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTSOP43234 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTSOP43234 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTSOP43234 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTSOP43234 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CTSOP43234 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTSOP43234 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTSOP43234 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CTSOP43234 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CTSOP43234 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CTSOP43234 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CTSOP43234 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTSOP43234 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTSOP43234 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CTSOP43234 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTSOP43234 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTSOP43234 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTSOP43234 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CTSOP43234 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CTSOP43234 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTSOP43234 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTSOP43234 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTSOP43234 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTSOP43234 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CTSOP43234 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTSOP43234 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTSOP43234 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTSOP43234 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTSOP43234 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTSOP43234 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTSOP43234 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CTSOP43234 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CTSOP43234 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CTSOP43234 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CTSOP43234 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CTSOP43234 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CTSOP43234 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTSOP43234 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTSOP43234 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTSOP43234 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTSOP43234 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CTSOP43234 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CTSOP43234 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.5 ms