Protein–RNA interactions for Protein: P42766

RPL35, 60S ribosomal protein L35, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL35P42766 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RPL35P42766 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RPL35P42766 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RPL35P42766 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RPL35P42766 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RPL35P42766 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RPL35P42766 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RPL35P42766 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RPL35P42766 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RPL35P42766 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RPL35P42766 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RPL35P42766 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RPL35P42766 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RPL35P42766 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RPL35P42766 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RPL35P42766 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RPL35P42766 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RPL35P42766 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RPL35P42766 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RPL35P42766 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RPL35P42766 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RPL35P42766 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RPL35P42766 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RPL35P42766 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RPL35P42766 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RPL35P42766 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RPL35P42766 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RPL35P42766 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RPL35P42766 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RPL35P42766 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RPL35P42766 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RPL35P42766 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
RPL35P42766 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RPL35P42766 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RPL35P42766 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RPL35P42766 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RPL35P42766 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RPL35P42766 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RPL35P42766 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RPL35P42766 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RPL35P42766 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RPL35P42766 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RPL35P42766 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RPL35P42766 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RPL35P42766 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
RPL35P42766 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RPL35P42766 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RPL35P42766 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RPL35P42766 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RPL35P42766 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RPL35P42766 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RPL35P42766 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RPL35P42766 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RPL35P42766 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RPL35P42766 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RPL35P42766 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RPL35P42766 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RPL35P42766 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RPL35P42766 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RPL35P42766 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RPL35P42766 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RPL35P42766 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RPL35P42766 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RPL35P42766 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RPL35P42766 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RPL35P42766 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RPL35P42766 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RPL35P42766 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RPL35P42766 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RPL35P42766 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RPL35P42766 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
RPL35P42766 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RPL35P42766 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
RPL35P42766 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
RPL35P42766 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RPL35P42766 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RPL35P42766 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RPL35P42766 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RPL35P42766 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RPL35P42766 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RPL35P42766 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RPL35P42766 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RPL35P42766 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RPL35P42766 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RPL35P42766 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RPL35P42766 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RPL35P42766 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RPL35P42766 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RPL35P42766 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RPL35P42766 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RPL35P42766 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RPL35P42766 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RPL35P42766 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RPL35P42766 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RPL35P42766 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RPL35P42766 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RPL35P42766 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RPL35P42766 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RPL35P42766 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RPL35P42766 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms