Protein–RNA interactions for Protein: P41271

NBL1, Neuroblastoma suppressor of tumorigenicity 1, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBL1P41271 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NBL1P41271 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
NBL1P41271 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NBL1P41271 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NBL1P41271 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NBL1P41271 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NBL1P41271 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NBL1P41271 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NBL1P41271 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NBL1P41271 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NBL1P41271 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NBL1P41271 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NBL1P41271 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
NBL1P41271 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NBL1P41271 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NBL1P41271 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NBL1P41271 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NBL1P41271 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NBL1P41271 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NBL1P41271 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
NBL1P41271 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NBL1P41271 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
NBL1P41271 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NBL1P41271 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NBL1P41271 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NBL1P41271 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NBL1P41271 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NBL1P41271 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NBL1P41271 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NBL1P41271 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NBL1P41271 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NBL1P41271 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NBL1P41271 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NBL1P41271 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NBL1P41271 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NBL1P41271 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NBL1P41271 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NBL1P41271 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NBL1P41271 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NBL1P41271 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
NBL1P41271 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NBL1P41271 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NBL1P41271 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NBL1P41271 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NBL1P41271 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NBL1P41271 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NBL1P41271 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NBL1P41271 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NBL1P41271 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NBL1P41271 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NBL1P41271 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NBL1P41271 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NBL1P41271 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NBL1P41271 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NBL1P41271 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NBL1P41271 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NBL1P41271 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NBL1P41271 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NBL1P41271 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NBL1P41271 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NBL1P41271 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NBL1P41271 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NBL1P41271 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
NBL1P41271 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NBL1P41271 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NBL1P41271 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NBL1P41271 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NBL1P41271 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NBL1P41271 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NBL1P41271 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NBL1P41271 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NBL1P41271 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NBL1P41271 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NBL1P41271 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NBL1P41271 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NBL1P41271 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NBL1P41271 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NBL1P41271 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NBL1P41271 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NBL1P41271 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NBL1P41271 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NBL1P41271 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NBL1P41271 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NBL1P41271 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NBL1P41271 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NBL1P41271 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NBL1P41271 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NBL1P41271 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NBL1P41271 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NBL1P41271 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
NBL1P41271 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NBL1P41271 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NBL1P41271 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NBL1P41271 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NBL1P41271 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NBL1P41271 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
NBL1P41271 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NBL1P41271 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NBL1P41271 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NBL1P41271 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.6 ms