Protein–RNA interactions for Protein: P41222

PTGDS, Prostaglandin-H2 D-isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDSP41222 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTGDSP41222 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTGDSP41222 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTGDSP41222 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTGDSP41222 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PTGDSP41222 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTGDSP41222 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTGDSP41222 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTGDSP41222 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTGDSP41222 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PTGDSP41222 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTGDSP41222 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTGDSP41222 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTGDSP41222 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTGDSP41222 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTGDSP41222 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTGDSP41222 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTGDSP41222 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTGDSP41222 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTGDSP41222 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTGDSP41222 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTGDSP41222 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTGDSP41222 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PTGDSP41222 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTGDSP41222 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTGDSP41222 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTGDSP41222 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTGDSP41222 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTGDSP41222 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PTGDSP41222 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTGDSP41222 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTGDSP41222 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTGDSP41222 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTGDSP41222 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTGDSP41222 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTGDSP41222 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTGDSP41222 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTGDSP41222 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTGDSP41222 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTGDSP41222 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTGDSP41222 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTGDSP41222 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTGDSP41222 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTGDSP41222 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTGDSP41222 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTGDSP41222 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTGDSP41222 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTGDSP41222 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTGDSP41222 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTGDSP41222 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTGDSP41222 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTGDSP41222 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTGDSP41222 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PTGDSP41222 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PTGDSP41222 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTGDSP41222 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTGDSP41222 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTGDSP41222 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTGDSP41222 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTGDSP41222 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTGDSP41222 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTGDSP41222 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTGDSP41222 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTGDSP41222 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTGDSP41222 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTGDSP41222 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTGDSP41222 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTGDSP41222 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTGDSP41222 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTGDSP41222 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTGDSP41222 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTGDSP41222 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PTGDSP41222 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTGDSP41222 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PTGDSP41222 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTGDSP41222 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTGDSP41222 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTGDSP41222 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTGDSP41222 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTGDSP41222 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTGDSP41222 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTGDSP41222 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTGDSP41222 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTGDSP41222 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTGDSP41222 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTGDSP41222 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTGDSP41222 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTGDSP41222 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTGDSP41222 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTGDSP41222 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTGDSP41222 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTGDSP41222 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTGDSP41222 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTGDSP41222 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTGDSP41222 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PTGDSP41222 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTGDSP41222 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
PTGDSP41222 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTGDSP41222 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTGDSP41222 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.8 ms