Protein–RNA interactions for Protein: P40547

VID28, Vacuolar import and degradation protein 28, yeastyeast

Predictions only

Length 921 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VID28P40547 GPH1YPR160W 2709 nt7.88□□□□□ -1.15
VID28P40547 BIO3YNR058W 1443 nt7.88□□□□□ -1.15
VID28P40547 TRS31YDR472W 852 nt7.88□□□□□ -1.15
VID28P40547 PUS4YNL292W 1212 nt7.88□□□□□ -1.15
VID28P40547 SPE3YPR069C 882 nt7.88□□□□□ -1.15
VID28P40547 AMN1YBR158W 1650 nt7.87□□□□□ -1.15
VID28P40547 VBA5YKR105C 1749 nt7.86□□□□□ -1.15
VID28P40547 KDX1YKL161C 1302 nt7.86□□□□□ -1.15
VID28P40547 MRPS28YDR337W 861 nt7.86□□□□□ -1.15
VID28P40547 RPL31BYLR406C 342 nt7.86□□□□□ -1.15
VID28P40547 ICP55YER078C 1536 nt7.85□□□□□ -1.15
VID28P40547 AIM2YAL049C 741 nt7.85□□□□□ -1.15
VID28P40547 LDB7YBL006C 543 nt7.85□□□□□ -1.15
VID28P40547 YOR111WYOR111W 699 nt7.85□□□□□ -1.15
VID28P40547 NUP49YGL172W 1419 nt7.85□□□□□ -1.15
VID28P40547 MSC3YLR219W 2187 nt7.84□□□□□ -1.15
VID28P40547 MAM3YOL060C 2121 nt7.84□□□□□ -1.15
VID28P40547 MRPL28YDR462W 444 nt7.84□□□□□ -1.15
VID28P40547 HHY1YEL059W 309 nt7.84□□□□□ -1.15
VID28P40547 PAC10YGR078C 600 nt7.84□□□□□ -1.15
VID28P40547 MIP1YOR330C 3765 nt7.84□□□□□ -1.15
VID28P40547 CCT3YJL014W 1605 nt7.84□□□□□ -1.15
VID28P40547 ATG22YCL038C 1587 nt7.84□□□□□ -1.15
VID28P40547 PRI1YIR008C 1230 nt7.83□□□□□ -1.16
VID28P40547 IDP3YNL009W 1263 nt7.83□□□□□ -1.16
VID28P40547 TUF1YOR187W 1314 nt7.82□□□□□ -1.16
VID28P40547 PAC2YER007W 1557 nt7.82□□□□□ -1.16
VID28P40547 AGX1YFL030W 1158 nt7.82□□□□□ -1.16
VID28P40547 YGL102CYGL102C 429 nt7.82□□□□□ -1.16
VID28P40547 CBR1YIL043C 855 nt7.82□□□□□ -1.16
VID28P40547 RMA1YKL132C 1293 nt7.82□□□□□ -1.16
VID28P40547 AAD14YNL331C 1131 nt7.82□□□□□ -1.16
VID28P40547 YPR076WYPR076W 375 nt7.82□□□□□ -1.16
VID28P40547 CDC13YDL220C 2775 nt7.81□□□□□ -1.16
VID28P40547 ERS1YCR075C 783 nt7.81□□□□□ -1.16
VID28P40547 MTR3YGR158C 753 nt7.81□□□□□ -1.16
VID28P40547 SEC62YPL094C 825 nt7.81□□□□□ -1.16
VID28P40547 SEC23YPR181C 2307 nt7.8□□□□□ -1.16
VID28P40547 MCH2YKL221W 1422 nt7.8□□□□□ -1.16
VID28P40547 TOM20YGR082W 552 nt7.8□□□□□ -1.16
VID28P40547 PTC7YHR076W 1032 nt7.8□□□□□ -1.16
VID28P40547 YLR122CYLR122C 378 nt7.8□□□□□ -1.16
VID28P40547 SMX3YPR182W 261 nt7.8□□□□□ -1.16
VID28P40547 GSH1YJL101C 2037 nt7.79□□□□□ -1.16
VID28P40547 ADE2YOR128C 1716 nt7.79□□□□□ -1.16
VID28P40547 COX15YER141W 1461 nt7.79□□□□□ -1.16
VID28P40547 EFM1YHL039W 1758 nt7.79□□□□□ -1.16
VID28P40547 PLB3YOL011W 2061 nt7.79□□□□□ -1.16
VID28P40547 MGM101YJR144W 810 nt7.78□□□□□ -1.16
VID28P40547 ARC35YNR035C 1029 nt7.78□□□□□ -1.16
VID28P40547 RGD2YFL047W 2145 nt7.78□□□□□ -1.16
VID28P40547 PPH21YDL134C 1110 nt7.77□□□□□ -1.17
VID28P40547 SRY1YKL218C 981 nt7.77□□□□□ -1.17
VID28P40547 YLL056CYLL056C 897 nt7.77□□□□□ -1.17
VID28P40547 ASR1YPR093C 867 nt7.77□□□□□ -1.17
VID28P40547 HBN1YCL026C-B 582 nt7.77□□□□□ -1.17
VID28P40547 REC114YMR133W 1287 nt7.76□□□□□ -1.17
VID28P40547 SSC1YJR045C 1965 nt7.76□□□□□ -1.17
VID28P40547 CRH1YGR189C 1524 nt7.76□□□□□ -1.17
VID28P40547 TAH11YJR046W 1815 nt7.75□□□□□ -1.17
VID28P40547 DOT1YDR440W 1749 nt7.75□□□□□ -1.17
VID28P40547 YSC83YHR017W 1158 nt7.75□□□□□ -1.17
VID28P40547 ARA2YMR041C 1008 nt7.75□□□□□ -1.17
VID28P40547 YBR241CYBR241C 1467 nt7.75□□□□□ -1.17
VID28P40547 CYB2YML054C 1776 nt7.74□□□□□ -1.17
VID28P40547 FMP40YPL222W 2067 nt7.74□□□□□ -1.17
VID28P40547 NTG1YAL015C 1200 nt7.74□□□□□ -1.17
VID28P40547 SRF1YDL133W 1314 nt7.74□□□□□ -1.17
VID28P40547 KIN1YDR122W 3195 nt7.73□□□□□ -1.17
VID28P40547 BNS1YGR230W 414 nt7.73□□□□□ -1.17
VID28P40547 HOC1YJR075W 1191 nt7.73□□□□□ -1.17
VID28P40547 YKL077WYKL077W 1179 nt7.73□□□□□ -1.17
VID28P40547 ATG17YLR423C 1254 nt7.73□□□□□ -1.17
VID28P40547 YBR113WYBR113W 483 nt7.73□□□□□ -1.17
VID28P40547 YDL177CYDL177C 513 nt7.72□□□□□ -1.17
VID28P40547 YGR068W-AYGR068W-A 96 nt7.72□□□□□ -1.17
VID28P40547 RPL2BYIL018W 765 nt7.72□□□□□ -1.17
VID28P40547 RDN5-2RDN5-2 119 nt7.72□□□□□ -1.17
VID28P40547 RDN5-3RDN5-3 119 nt7.72□□□□□ -1.17
VID28P40547 RDN5-4RDN5-4 119 nt7.72□□□□□ -1.17
VID28P40547 RDN5-5RDN5-5 119 nt7.72□□□□□ -1.17
VID28P40547 PPS1YBR276C 2424 nt7.72□□□□□ -1.17
VID28P40547 YNR014WYNR014W 639 nt7.71□□□□□ -1.18
VID28P40547 LSC1YOR142W 990 nt7.71□□□□□ -1.18
VID28P40547 CYS4YGR155W 1524 nt7.7□□□□□ -1.18
VID28P40547 HED1YDR014W-A 489 nt7.7□□□□□ -1.18
VID28P40547 LIA1YJR070C 978 nt7.7□□□□□ -1.18
VID28P40547 MRPL19YNL185C 477 nt7.7□□□□□ -1.18
VID28P40547 IRC11YOR013W 471 nt7.7□□□□□ -1.18
VID28P40547 YHR131CYHR131C 2553 nt7.7□□□□□ -1.18
VID28P40547 YHR020WYHR020W 2067 nt7.69□□□□□ -1.18
VID28P40547 YMR034CYMR034C 1305 nt7.69□□□□□ -1.18
VID28P40547 HDA1YNL021W 2121 nt7.69□□□□□ -1.18
VID28P40547 SWD1YAR003W 1281 nt7.68□□□□□ -1.18
VID28P40547 STT3YGL022W 2157 nt7.68□□□□□ -1.18
VID28P40547 FCY22YER060W-A 1593 nt7.67□□□□□ -1.18
VID28P40547 YFL013W-AYFL013W-A 804 nt7.67□□□□□ -1.18
VID28P40547 COQ1YBR003W 1422 nt7.67□□□□□ -1.18
VID28P40547 YLL066CYLL066C 3618 nt7.67□□□□□ -1.18
VID28P40547 SNU66YOR308C 1764 nt7.66□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 53.2 ms