Protein–RNA interactions for Protein: P40505

SDS3, Transcriptional regulatory protein SDS3, yeastyeast

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SDS3P40505 YOR012WYOR012W 414 nt7.47□□□□□ -1.21
SDS3P40505 NAF1YNL124W 1479 nt7.47□□□□□ -1.21
SDS3P40505 MIX17YMR002W 471 nt7.46□□□□□ -1.22
SDS3P40505 SNT309YPR101W 528 nt7.46□□□□□ -1.22
SDS3P40505 MHP1YJL042W 4197 nt7.45□□□□□ -1.22
SDS3P40505 ICL2YPR006C 1728 nt7.45□□□□□ -1.22
SDS3P40505 BMT5YIL096C 1011 nt7.45□□□□□ -1.22
SDS3P40505 YNR005CYNR005C 405 nt7.45□□□□□ -1.22
SDS3P40505 TDP1YBR223C 1635 nt7.45□□□□□ -1.22
SDS3P40505 AGP2YBR132C 1791 nt7.44□□□□□ -1.22
SDS3P40505 YAL045CYAL045C 309 nt7.44□□□□□ -1.22
SDS3P40505 HTZ1YOL012C 405 nt7.44□□□□□ -1.22
SDS3P40505 YOL099CYOL099C 492 nt7.44□□□□□ -1.22
SDS3P40505 YCL049CYCL049C 939 nt7.44□□□□□ -1.22
SDS3P40505 CEM1YER061C 1329 nt7.43□□□□□ -1.22
SDS3P40505 MTR3YGR158C 753 nt7.42□□□□□ -1.22
SDS3P40505 YIR018C-AYIR018C-A 138 nt7.42□□□□□ -1.22
SDS3P40505 NTG2YOL043C 1143 nt7.41□□□□□ -1.22
SDS3P40505 MSG5YNL053W 1470 nt7.41□□□□□ -1.22
SDS3P40505 MRPL28YDR462W 444 nt7.4□□□□□ -1.22
SDS3P40505 AMN1YBR158W 1650 nt7.4□□□□□ -1.23
SDS3P40505 TRR1YDR353W 960 nt7.39□□□□□ -1.23
SDS3P40505 TUF1YOR187W 1314 nt7.38□□□□□ -1.23
SDS3P40505 ERS1YCR075C 783 nt7.38□□□□□ -1.23
SDS3P40505 REC107YJR021C 945 nt7.38□□□□□ -1.23
SDS3P40505 YNL067W-AYNL067W-A 147 nt7.38□□□□□ -1.23
SDS3P40505 PUS4YNL292W 1212 nt7.38□□□□□ -1.23
SDS3P40505 ZIM17YNL310C 525 nt7.38□□□□□ -1.23
SDS3P40505 YPL041CYPL041C 624 nt7.37□□□□□ -1.23
SDS3P40505 ARC35YNR035C 1029 nt7.36□□□□□ -1.23
SDS3P40505 APE4YHR113W 1473 nt7.36□□□□□ -1.23
SDS3P40505 DAL4YIR028W 1908 nt7.35□□□□□ -1.23
SDS3P40505 YGR068W-AYGR068W-A 96 nt7.35□□□□□ -1.23
SDS3P40505 PAC10YGR078C 600 nt7.35□□□□□ -1.23
SDS3P40505 PTC7YHR076W 1032 nt7.35□□□□□ -1.23
SDS3P40505 SML1YML058W 315 nt7.35□□□□□ -1.23
SDS3P40505 AAD14YNL331C 1131 nt7.35□□□□□ -1.23
SDS3P40505 LGE1YPL055C 999 nt7.35□□□□□ -1.23
SDS3P40505 SPE3YPR069C 882 nt7.35□□□□□ -1.23
SDS3P40505 YGL102CYGL102C 429 nt7.34□□□□□ -1.23
SDS3P40505 COG1YGL223C 1254 nt7.34□□□□□ -1.23
SDS3P40505 RPL31BYLR406C 342 nt7.34□□□□□ -1.23
SDS3P40505 YBR241CYBR241C 1467 nt7.33□□□□□ -1.24
SDS3P40505 GAL83YER027C 1254 nt7.33□□□□□ -1.24
SDS3P40505 MCP1YOR228C 909 nt7.33□□□□□ -1.24
SDS3P40505 YPR076WYPR076W 375 nt7.33□□□□□ -1.24
SDS3P40505 SMX3YPR182W 261 nt7.33□□□□□ -1.24
SDS3P40505 MCH2YKL221W 1422 nt7.33□□□□□ -1.24
SDS3P40505 YLL058WYLL058W 1728 nt7.32□□□□□ -1.24
SDS3P40505 YJL163CYJL163C 1668 nt7.32□□□□□ -1.24
SDS3P40505 RDN5-2RDN5-2 119 nt7.32□□□□□ -1.24
SDS3P40505 RDN5-3RDN5-3 119 nt7.32□□□□□ -1.24
SDS3P40505 RDN5-4RDN5-4 119 nt7.32□□□□□ -1.24
SDS3P40505 RDN5-5RDN5-5 119 nt7.32□□□□□ -1.24
SDS3P40505 ERG10YPL028W 1197 nt7.32□□□□□ -1.24
SDS3P40505 NUP84YDL116W 2181 nt7.31□□□□□ -1.24
SDS3P40505 HHY1YEL059W 309 nt7.31□□□□□ -1.24
SDS3P40505 BIM1YER016W 1035 nt7.31□□□□□ -1.24
SDS3P40505 CBR1YIL043C 855 nt7.31□□□□□ -1.24
SDS3P40505 YLL056CYLL056C 897 nt7.31□□□□□ -1.24
SDS3P40505 DPH5YLR172C 903 nt7.31□□□□□ -1.24
SDS3P40505 SPG5YMR191W 1122 nt7.31□□□□□ -1.24
SDS3P40505 MRPL19YNL185C 477 nt7.31□□□□□ -1.24
SDS3P40505 AGX1YFL030W 1158 nt7.3□□□□□ -1.24
SDS3P40505 YOL046CYOL046C 675 nt7.3□□□□□ -1.24
SDS3P40505 CYB2YML054C 1776 nt7.3□□□□□ -1.24
SDS3P40505 VBA5YKR105C 1749 nt7.3□□□□□ -1.24
SDS3P40505 SRF1YDL133W 1314 nt7.29□□□□□ -1.24
SDS3P40505 YHM2YMR241W 945 nt7.29□□□□□ -1.24
SDS3P40505 FIT2YOR382W 462 nt7.29□□□□□ -1.24
SDS3P40505 PAC2YER007W 1557 nt7.29□□□□□ -1.24
SDS3P40505 ERG12YMR208W 1332 nt7.28□□□□□ -1.24
SDS3P40505 ICP55YER078C 1536 nt7.28□□□□□ -1.24
SDS3P40505 PMP3YDR276C 168 nt7.28□□□□□ -1.24
SDS3P40505 QCR6YFR033C 444 nt7.28□□□□□ -1.24
SDS3P40505 YOR389WYOR389W 1875 nt7.28□□□□□ -1.24
SDS3P40505 YMR034CYMR034C 1305 nt7.27□□□□□ -1.24
SDS3P40505 PRI1YIR008C 1230 nt7.27□□□□□ -1.25
SDS3P40505 HBN1YCL026C-B 582 nt7.27□□□□□ -1.25
SDS3P40505 PPS1YBR276C 2424 nt7.27□□□□□ -1.25
SDS3P40505 MSC3YLR219W 2187 nt7.26□□□□□ -1.25
SDS3P40505 HED1YDR014W-A 489 nt7.26□□□□□ -1.25
SDS3P40505 MRPS28YDR337W 861 nt7.26□□□□□ -1.25
SDS3P40505 LDB7YBL006C 543 nt7.26□□□□□ -1.25
SDS3P40505 GPA1YHR005C 1419 nt7.26□□□□□ -1.25
SDS3P40505 SSC1YJR045C 1965 nt7.26□□□□□ -1.25
SDS3P40505 ECM30YLR436C 3825 nt7.25□□□□□ -1.25
SDS3P40505 YDL177CYDL177C 513 nt7.25□□□□□ -1.25
SDS3P40505 ARP10YDR106W 855 nt7.25□□□□□ -1.25
SDS3P40505 RPL2BYIL018W 765 nt7.25□□□□□ -1.25
SDS3P40505 YTH1YPR107C 627 nt7.25□□□□□ -1.25
SDS3P40505 BIO3YNR058W 1443 nt7.25□□□□□ -1.25
SDS3P40505 TAH11YJR046W 1815 nt7.24□□□□□ -1.25
SDS3P40505 PPH21YDL134C 1110 nt7.24□□□□□ -1.25
SDS3P40505 YFL013W-AYFL013W-A 804 nt7.24□□□□□ -1.25
SDS3P40505 NTG1YAL015C 1200 nt7.24□□□□□ -1.25
SDS3P40505 SEC62YPL094C 825 nt7.24□□□□□ -1.25
SDS3P40505 YHR131CYHR131C 2553 nt7.24□□□□□ -1.25
SDS3P40505 NUP49YGL172W 1419 nt7.24□□□□□ -1.25
SDS3P40505 RGD2YFL047W 2145 nt7.24□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12.5 ms