Protein–RNA interactions for Protein: P36578

RPL4, 60S ribosomal protein L4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL4P36578 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPL4P36578 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPL4P36578 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPL4P36578 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPL4P36578 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPL4P36578 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPL4P36578 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPL4P36578 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RPL4P36578 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPL4P36578 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPL4P36578 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPL4P36578 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPL4P36578 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPL4P36578 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPL4P36578 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPL4P36578 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPL4P36578 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPL4P36578 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPL4P36578 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPL4P36578 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPL4P36578 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPL4P36578 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPL4P36578 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPL4P36578 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RPL4P36578 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPL4P36578 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RPL4P36578 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPL4P36578 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPL4P36578 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPL4P36578 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPL4P36578 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPL4P36578 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPL4P36578 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPL4P36578 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPL4P36578 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPL4P36578 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPL4P36578 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPL4P36578 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPL4P36578 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPL4P36578 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPL4P36578 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPL4P36578 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPL4P36578 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPL4P36578 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPL4P36578 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPL4P36578 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPL4P36578 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPL4P36578 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPL4P36578 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPL4P36578 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPL4P36578 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPL4P36578 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPL4P36578 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RPL4P36578 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RPL4P36578 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RPL4P36578 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RPL4P36578 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RPL4P36578 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RPL4P36578 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RPL4P36578 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RPL4P36578 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RPL4P36578 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPL4P36578 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPL4P36578 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPL4P36578 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPL4P36578 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPL4P36578 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPL4P36578 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPL4P36578 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPL4P36578 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPL4P36578 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPL4P36578 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPL4P36578 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPL4P36578 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPL4P36578 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RPL4P36578 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPL4P36578 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPL4P36578 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RPL4P36578 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RPL4P36578 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RPL4P36578 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPL4P36578 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPL4P36578 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPL4P36578 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPL4P36578 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPL4P36578 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPL4P36578 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPL4P36578 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RPL4P36578 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPL4P36578 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPL4P36578 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPL4P36578 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPL4P36578 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPL4P36578 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPL4P36578 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPL4P36578 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPL4P36578 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RPL4P36578 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RPL4P36578 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPL4P36578 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms