Protein–RNA interactions for Protein: P32926

DSG3, Desmoglein-3, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG3P32926 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
DSG3P32926 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
DSG3P32926 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
DSG3P32926 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
DSG3P32926 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
DSG3P32926 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
DSG3P32926 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
DSG3P32926 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
DSG3P32926 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
DSG3P32926 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
DSG3P32926 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
DSG3P32926 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
DSG3P32926 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
DSG3P32926 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
DSG3P32926 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
DSG3P32926 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
DSG3P32926 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
DSG3P32926 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
DSG3P32926 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
DSG3P32926 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
DSG3P32926 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
DSG3P32926 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
DSG3P32926 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
DSG3P32926 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
DSG3P32926 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
DSG3P32926 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
DSG3P32926 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
DSG3P32926 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
DSG3P32926 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
DSG3P32926 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
DSG3P32926 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
DSG3P32926 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
DSG3P32926 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
DSG3P32926 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
DSG3P32926 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
DSG3P32926 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
DSG3P32926 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.65■■■□□ 2.18
DSG3P32926 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
DSG3P32926 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
DSG3P32926 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
DSG3P32926 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
DSG3P32926 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
DSG3P32926 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
DSG3P32926 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
DSG3P32926 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
DSG3P32926 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
DSG3P32926 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
DSG3P32926 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
DSG3P32926 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
DSG3P32926 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
DSG3P32926 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
DSG3P32926 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
DSG3P32926 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
DSG3P32926 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
DSG3P32926 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
DSG3P32926 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
DSG3P32926 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
DSG3P32926 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
DSG3P32926 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
DSG3P32926 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
DSG3P32926 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
DSG3P32926 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
DSG3P32926 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
DSG3P32926 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
DSG3P32926 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
DSG3P32926 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
DSG3P32926 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
DSG3P32926 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
DSG3P32926 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
DSG3P32926 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
DSG3P32926 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
DSG3P32926 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
DSG3P32926 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
DSG3P32926 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
DSG3P32926 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
DSG3P32926 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
DSG3P32926 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
DSG3P32926 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
DSG3P32926 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
DSG3P32926 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
DSG3P32926 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
DSG3P32926 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
DSG3P32926 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
DSG3P32926 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
DSG3P32926 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
DSG3P32926 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
DSG3P32926 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
DSG3P32926 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
DSG3P32926 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
DSG3P32926 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
DSG3P32926 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
DSG3P32926 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
DSG3P32926 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
DSG3P32926 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
DSG3P32926 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
DSG3P32926 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
DSG3P32926 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
DSG3P32926 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
DSG3P32926 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
DSG3P32926 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms