Protein–RNA interactions for Protein: P32302

CXCR5, C-X-C chemokine receptor type 5, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR5P32302 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CXCR5P32302 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CXCR5P32302 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CXCR5P32302 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CXCR5P32302 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CXCR5P32302 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CXCR5P32302 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CXCR5P32302 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CXCR5P32302 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CXCR5P32302 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CXCR5P32302 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CXCR5P32302 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CXCR5P32302 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CXCR5P32302 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CXCR5P32302 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CXCR5P32302 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CXCR5P32302 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CXCR5P32302 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CXCR5P32302 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CXCR5P32302 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CXCR5P32302 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CXCR5P32302 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CXCR5P32302 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CXCR5P32302 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CXCR5P32302 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CXCR5P32302 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CXCR5P32302 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CXCR5P32302 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CXCR5P32302 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CXCR5P32302 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CXCR5P32302 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CXCR5P32302 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CXCR5P32302 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CXCR5P32302 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CXCR5P32302 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CXCR5P32302 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CXCR5P32302 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CXCR5P32302 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CXCR5P32302 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CXCR5P32302 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CXCR5P32302 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CXCR5P32302 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CXCR5P32302 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CXCR5P32302 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CXCR5P32302 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CXCR5P32302 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CXCR5P32302 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CXCR5P32302 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CXCR5P32302 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CXCR5P32302 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CXCR5P32302 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CXCR5P32302 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CXCR5P32302 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CXCR5P32302 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CXCR5P32302 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CXCR5P32302 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CXCR5P32302 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CXCR5P32302 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CXCR5P32302 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CXCR5P32302 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CXCR5P32302 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CXCR5P32302 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CXCR5P32302 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CXCR5P32302 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CXCR5P32302 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CXCR5P32302 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CXCR5P32302 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CXCR5P32302 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CXCR5P32302 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CXCR5P32302 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CXCR5P32302 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CXCR5P32302 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CXCR5P32302 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CXCR5P32302 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CXCR5P32302 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CXCR5P32302 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CXCR5P32302 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CXCR5P32302 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CXCR5P32302 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CXCR5P32302 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CXCR5P32302 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CXCR5P32302 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CXCR5P32302 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CXCR5P32302 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CXCR5P32302 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CXCR5P32302 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CXCR5P32302 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CXCR5P32302 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CXCR5P32302 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CXCR5P32302 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CXCR5P32302 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CXCR5P32302 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CXCR5P32302 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CXCR5P32302 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CXCR5P32302 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CXCR5P32302 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CXCR5P32302 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CXCR5P32302 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CXCR5P32302 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CXCR5P32302 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms