Protein–RNA interactions for Protein: P31273

HOXC8, Homeobox protein Hox-C8, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC8P31273 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
HOXC8P31273 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
HOXC8P31273 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HOXC8P31273 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HOXC8P31273 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HOXC8P31273 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HOXC8P31273 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HOXC8P31273 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HOXC8P31273 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HOXC8P31273 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
HOXC8P31273 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HOXC8P31273 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
HOXC8P31273 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
HOXC8P31273 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
HOXC8P31273 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
HOXC8P31273 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
HOXC8P31273 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
HOXC8P31273 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HOXC8P31273 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HOXC8P31273 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HOXC8P31273 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
HOXC8P31273 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
HOXC8P31273 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
HOXC8P31273 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HOXC8P31273 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
HOXC8P31273 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
HOXC8P31273 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
HOXC8P31273 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
HOXC8P31273 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
HOXC8P31273 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HOXC8P31273 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HOXC8P31273 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HOXC8P31273 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
HOXC8P31273 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HOXC8P31273 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
HOXC8P31273 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HOXC8P31273 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
HOXC8P31273 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
HOXC8P31273 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
HOXC8P31273 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
HOXC8P31273 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
HOXC8P31273 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HOXC8P31273 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HOXC8P31273 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HOXC8P31273 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HOXC8P31273 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HOXC8P31273 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HOXC8P31273 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
HOXC8P31273 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HOXC8P31273 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
HOXC8P31273 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HOXC8P31273 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HOXC8P31273 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HOXC8P31273 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
HOXC8P31273 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
HOXC8P31273 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
HOXC8P31273 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HOXC8P31273 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HOXC8P31273 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
HOXC8P31273 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
HOXC8P31273 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HOXC8P31273 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HOXC8P31273 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
HOXC8P31273 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HOXC8P31273 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
HOXC8P31273 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HOXC8P31273 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HOXC8P31273 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HOXC8P31273 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HOXC8P31273 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HOXC8P31273 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
HOXC8P31273 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HOXC8P31273 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HOXC8P31273 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HOXC8P31273 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
HOXC8P31273 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
HOXC8P31273 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HOXC8P31273 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HOXC8P31273 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
HOXC8P31273 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
HOXC8P31273 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
HOXC8P31273 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HOXC8P31273 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
HOXC8P31273 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HOXC8P31273 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HOXC8P31273 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
HOXC8P31273 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HOXC8P31273 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
HOXC8P31273 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HOXC8P31273 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HOXC8P31273 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HOXC8P31273 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HOXC8P31273 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HOXC8P31273 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
HOXC8P31273 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HOXC8P31273 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HOXC8P31273 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
HOXC8P31273 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HOXC8P31273 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HOXC8P31273 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.4 ms