Protein–RNA interactions for Protein: P29536

LMOD1, Leiomodin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD1P29536 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
LMOD1P29536 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
LMOD1P29536 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
LMOD1P29536 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
LMOD1P29536 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
LMOD1P29536 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
LMOD1P29536 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
LMOD1P29536 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
LMOD1P29536 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
LMOD1P29536 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
LMOD1P29536 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
LMOD1P29536 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
LMOD1P29536 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
LMOD1P29536 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
LMOD1P29536 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
LMOD1P29536 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
LMOD1P29536 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
LMOD1P29536 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
LMOD1P29536 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
LMOD1P29536 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
LMOD1P29536 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
LMOD1P29536 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
LMOD1P29536 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
LMOD1P29536 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC30.31■■■□□ 2.44
LMOD1P29536 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
LMOD1P29536 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
LMOD1P29536 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
LMOD1P29536 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
LMOD1P29536 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC30.29■■■□□ 2.44
LMOD1P29536 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
LMOD1P29536 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
LMOD1P29536 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
LMOD1P29536 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
LMOD1P29536 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
LMOD1P29536 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
LMOD1P29536 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
LMOD1P29536 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
LMOD1P29536 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
LMOD1P29536 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
LMOD1P29536 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
LMOD1P29536 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
LMOD1P29536 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
LMOD1P29536 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
LMOD1P29536 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
LMOD1P29536 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
LMOD1P29536 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
LMOD1P29536 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
LMOD1P29536 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
LMOD1P29536 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
LMOD1P29536 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
LMOD1P29536 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
LMOD1P29536 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
LMOD1P29536 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
LMOD1P29536 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
LMOD1P29536 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
LMOD1P29536 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
LMOD1P29536 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
LMOD1P29536 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
LMOD1P29536 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
LMOD1P29536 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
LMOD1P29536 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
LMOD1P29536 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
LMOD1P29536 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
LMOD1P29536 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
LMOD1P29536 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
LMOD1P29536 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
LMOD1P29536 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
LMOD1P29536 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
LMOD1P29536 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
LMOD1P29536 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
LMOD1P29536 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
LMOD1P29536 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
LMOD1P29536 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
LMOD1P29536 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
LMOD1P29536 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
LMOD1P29536 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
LMOD1P29536 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
LMOD1P29536 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
LMOD1P29536 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC30.21■■■□□ 2.43
LMOD1P29536 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
LMOD1P29536 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
LMOD1P29536 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
LMOD1P29536 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC30.19■■■□□ 2.42
LMOD1P29536 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
LMOD1P29536 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
LMOD1P29536 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
LMOD1P29536 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
LMOD1P29536 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
LMOD1P29536 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
LMOD1P29536 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
LMOD1P29536 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
LMOD1P29536 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
LMOD1P29536 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
LMOD1P29536 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
LMOD1P29536 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
LMOD1P29536 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
LMOD1P29536 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
LMOD1P29536 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
LMOD1P29536 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
LMOD1P29536 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.6 ms