Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
ARID4AP29374 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
ARID4AP29374 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
ARID4AP29374 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
ARID4AP29374 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC30.2■■■□□ 2.43
ARID4AP29374 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
ARID4AP29374 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
ARID4AP29374 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
ARID4AP29374 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
ARID4AP29374 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
ARID4AP29374 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
ARID4AP29374 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
ARID4AP29374 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
ARID4AP29374 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
ARID4AP29374 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
ARID4AP29374 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
ARID4AP29374 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
ARID4AP29374 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
ARID4AP29374 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
ARID4AP29374 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
ARID4AP29374 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
ARID4AP29374 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
ARID4AP29374 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
ARID4AP29374 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
ARID4AP29374 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
ARID4AP29374 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
ARID4AP29374 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ARID4AP29374 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
ARID4AP29374 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
ARID4AP29374 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
ARID4AP29374 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
ARID4AP29374 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
ARID4AP29374 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
ARID4AP29374 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
ARID4AP29374 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
ARID4AP29374 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
ARID4AP29374 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ARID4AP29374 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
ARID4AP29374 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
ARID4AP29374 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
ARID4AP29374 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
ARID4AP29374 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ARID4AP29374 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
ARID4AP29374 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
ARID4AP29374 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
ARID4AP29374 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
ARID4AP29374 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
ARID4AP29374 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
ARID4AP29374 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
ARID4AP29374 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
ARID4AP29374 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
ARID4AP29374 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
ARID4AP29374 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
ARID4AP29374 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
ARID4AP29374 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
ARID4AP29374 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
ARID4AP29374 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
ARID4AP29374 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
ARID4AP29374 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
ARID4AP29374 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ARID4AP29374 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
ARID4AP29374 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC30.07■■■□□ 2.4
ARID4AP29374 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
ARID4AP29374 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
ARID4AP29374 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ARID4AP29374 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
ARID4AP29374 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
ARID4AP29374 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ARID4AP29374 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
ARID4AP29374 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
ARID4AP29374 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ARID4AP29374 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
ARID4AP29374 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ARID4AP29374 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ARID4AP29374 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
ARID4AP29374 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ARID4AP29374 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ARID4AP29374 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ARID4AP29374 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
ARID4AP29374 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
ARID4AP29374 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ARID4AP29374 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
ARID4AP29374 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ARID4AP29374 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
ARID4AP29374 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ARID4AP29374 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
ARID4AP29374 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
ARID4AP29374 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
ARID4AP29374 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
ARID4AP29374 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ARID4AP29374 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
ARID4AP29374 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ARID4AP29374 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
ARID4AP29374 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ARID4AP29374 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ARID4AP29374 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
ARID4AP29374 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
ARID4AP29374 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ARID4AP29374 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ARID4AP29374 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms