Protein–RNA interactions for Protein: P23975

SLC6A2, Sodium-dependent noradrenaline transporter, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A2P23975 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC6A2P23975 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC6A2P23975 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC6A2P23975 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC6A2P23975 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC6A2P23975 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC6A2P23975 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC6A2P23975 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC6A2P23975 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC6A2P23975 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC6A2P23975 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC6A2P23975 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC6A2P23975 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC6A2P23975 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC6A2P23975 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC6A2P23975 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC6A2P23975 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC6A2P23975 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC6A2P23975 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC6A2P23975 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC6A2P23975 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC6A2P23975 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC6A2P23975 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC6A2P23975 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC6A2P23975 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC6A2P23975 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC6A2P23975 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC6A2P23975 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC6A2P23975 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC6A2P23975 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC6A2P23975 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC6A2P23975 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC6A2P23975 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC6A2P23975 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC6A2P23975 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC6A2P23975 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC6A2P23975 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC6A2P23975 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC6A2P23975 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC6A2P23975 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC6A2P23975 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC6A2P23975 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC6A2P23975 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC6A2P23975 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC6A2P23975 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC6A2P23975 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC6A2P23975 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC6A2P23975 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC6A2P23975 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC6A2P23975 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC6A2P23975 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC6A2P23975 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC6A2P23975 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC6A2P23975 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC6A2P23975 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC6A2P23975 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC6A2P23975 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC6A2P23975 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC6A2P23975 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC6A2P23975 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC6A2P23975 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC6A2P23975 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC6A2P23975 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC6A2P23975 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC6A2P23975 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC6A2P23975 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC6A2P23975 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC6A2P23975 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC6A2P23975 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC6A2P23975 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC6A2P23975 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC6A2P23975 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC6A2P23975 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC6A2P23975 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC6A2P23975 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC6A2P23975 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC6A2P23975 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC6A2P23975 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC6A2P23975 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC6A2P23975 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC6A2P23975 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC6A2P23975 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC6A2P23975 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC6A2P23975 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC6A2P23975 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC6A2P23975 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC6A2P23975 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC6A2P23975 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC6A2P23975 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC6A2P23975 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC6A2P23975 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC6A2P23975 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC6A2P23975 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC6A2P23975 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC6A2P23975 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC6A2P23975 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC6A2P23975 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC6A2P23975 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC6A2P23975 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC6A2P23975 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms