Protein–RNA interactions for Protein: P23942

PRPH2, Peripherin-2, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPH2P23942 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRPH2P23942 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRPH2P23942 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRPH2P23942 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PRPH2P23942 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PRPH2P23942 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PRPH2P23942 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRPH2P23942 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRPH2P23942 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRPH2P23942 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRPH2P23942 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRPH2P23942 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRPH2P23942 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRPH2P23942 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRPH2P23942 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRPH2P23942 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRPH2P23942 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRPH2P23942 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRPH2P23942 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRPH2P23942 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRPH2P23942 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRPH2P23942 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PRPH2P23942 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRPH2P23942 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRPH2P23942 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRPH2P23942 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRPH2P23942 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRPH2P23942 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRPH2P23942 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRPH2P23942 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRPH2P23942 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRPH2P23942 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRPH2P23942 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PRPH2P23942 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PRPH2P23942 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PRPH2P23942 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PRPH2P23942 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRPH2P23942 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRPH2P23942 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRPH2P23942 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRPH2P23942 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRPH2P23942 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRPH2P23942 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRPH2P23942 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRPH2P23942 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRPH2P23942 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRPH2P23942 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRPH2P23942 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRPH2P23942 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRPH2P23942 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRPH2P23942 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRPH2P23942 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRPH2P23942 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRPH2P23942 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRPH2P23942 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRPH2P23942 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRPH2P23942 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRPH2P23942 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRPH2P23942 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRPH2P23942 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PRPH2P23942 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRPH2P23942 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRPH2P23942 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRPH2P23942 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRPH2P23942 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRPH2P23942 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRPH2P23942 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRPH2P23942 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRPH2P23942 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRPH2P23942 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRPH2P23942 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRPH2P23942 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRPH2P23942 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRPH2P23942 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRPH2P23942 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRPH2P23942 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRPH2P23942 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PRPH2P23942 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRPH2P23942 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRPH2P23942 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRPH2P23942 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRPH2P23942 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRPH2P23942 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRPH2P23942 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRPH2P23942 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRPH2P23942 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRPH2P23942 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRPH2P23942 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRPH2P23942 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRPH2P23942 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRPH2P23942 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRPH2P23942 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRPH2P23942 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRPH2P23942 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRPH2P23942 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRPH2P23942 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRPH2P23942 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRPH2P23942 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRPH2P23942 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRPH2P23942 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms