Protein–RNA interactions for Protein: P23471

PTPRZ1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRZ1P23471 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PTPRZ1P23471 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
PTPRZ1P23471 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPRZ1P23471 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPRZ1P23471 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPRZ1P23471 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPRZ1P23471 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPRZ1P23471 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPRZ1P23471 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRZ1P23471 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRZ1P23471 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRZ1P23471 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRZ1P23471 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRZ1P23471 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRZ1P23471 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRZ1P23471 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRZ1P23471 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRZ1P23471 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRZ1P23471 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRZ1P23471 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRZ1P23471 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRZ1P23471 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRZ1P23471 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PTPRZ1P23471 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PTPRZ1P23471 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PTPRZ1P23471 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PTPRZ1P23471 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PTPRZ1P23471 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PTPRZ1P23471 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRZ1P23471 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRZ1P23471 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRZ1P23471 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRZ1P23471 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRZ1P23471 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRZ1P23471 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRZ1P23471 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRZ1P23471 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRZ1P23471 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRZ1P23471 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRZ1P23471 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRZ1P23471 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRZ1P23471 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRZ1P23471 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRZ1P23471 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRZ1P23471 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRZ1P23471 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRZ1P23471 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRZ1P23471 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRZ1P23471 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRZ1P23471 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRZ1P23471 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRZ1P23471 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRZ1P23471 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRZ1P23471 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRZ1P23471 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRZ1P23471 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRZ1P23471 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRZ1P23471 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRZ1P23471 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRZ1P23471 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRZ1P23471 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRZ1P23471 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPRZ1P23471 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPRZ1P23471 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPRZ1P23471 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPRZ1P23471 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPRZ1P23471 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRZ1P23471 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRZ1P23471 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRZ1P23471 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRZ1P23471 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRZ1P23471 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRZ1P23471 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRZ1P23471 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRZ1P23471 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRZ1P23471 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRZ1P23471 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRZ1P23471 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRZ1P23471 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRZ1P23471 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRZ1P23471 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRZ1P23471 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRZ1P23471 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRZ1P23471 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRZ1P23471 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRZ1P23471 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRZ1P23471 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRZ1P23471 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRZ1P23471 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRZ1P23471 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRZ1P23471 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRZ1P23471 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRZ1P23471 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRZ1P23471 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRZ1P23471 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRZ1P23471 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRZ1P23471 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRZ1P23471 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRZ1P23471 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRZ1P23471 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms