Protein–RNA interactions for Protein: P23409

MYF6, Myogenic factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYF6P23409 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MYF6P23409 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
MYF6P23409 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYF6P23409 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYF6P23409 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYF6P23409 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYF6P23409 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYF6P23409 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYF6P23409 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYF6P23409 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYF6P23409 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYF6P23409 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYF6P23409 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYF6P23409 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYF6P23409 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYF6P23409 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MYF6P23409 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYF6P23409 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYF6P23409 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYF6P23409 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYF6P23409 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYF6P23409 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYF6P23409 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MYF6P23409 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MYF6P23409 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MYF6P23409 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MYF6P23409 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MYF6P23409 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MYF6P23409 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
MYF6P23409 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
MYF6P23409 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
MYF6P23409 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MYF6P23409 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MYF6P23409 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MYF6P23409 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MYF6P23409 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MYF6P23409 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MYF6P23409 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MYF6P23409 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MYF6P23409 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MYF6P23409 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MYF6P23409 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MYF6P23409 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MYF6P23409 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MYF6P23409 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MYF6P23409 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MYF6P23409 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MYF6P23409 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MYF6P23409 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MYF6P23409 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MYF6P23409 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MYF6P23409 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MYF6P23409 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MYF6P23409 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MYF6P23409 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MYF6P23409 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MYF6P23409 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MYF6P23409 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MYF6P23409 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MYF6P23409 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MYF6P23409 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MYF6P23409 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MYF6P23409 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MYF6P23409 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MYF6P23409 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MYF6P23409 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MYF6P23409 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MYF6P23409 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
MYF6P23409 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MYF6P23409 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MYF6P23409 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MYF6P23409 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MYF6P23409 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MYF6P23409 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MYF6P23409 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MYF6P23409 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MYF6P23409 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MYF6P23409 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MYF6P23409 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MYF6P23409 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MYF6P23409 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
MYF6P23409 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MYF6P23409 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MYF6P23409 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MYF6P23409 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MYF6P23409 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MYF6P23409 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MYF6P23409 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MYF6P23409 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MYF6P23409 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
MYF6P23409 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MYF6P23409 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
MYF6P23409 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MYF6P23409 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MYF6P23409 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MYF6P23409 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MYF6P23409 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MYF6P23409 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MYF6P23409 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MYF6P23409 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms