Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
ITGA6P23229 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
ITGA6P23229 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
ITGA6P23229 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
ITGA6P23229 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
ITGA6P23229 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
ITGA6P23229 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
ITGA6P23229 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
ITGA6P23229 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
ITGA6P23229 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC30.85■■■□□ 2.53
ITGA6P23229 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
ITGA6P23229 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
ITGA6P23229 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
ITGA6P23229 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
ITGA6P23229 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
ITGA6P23229 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC30.83■■■□□ 2.53
ITGA6P23229 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
ITGA6P23229 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
ITGA6P23229 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
ITGA6P23229 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
ITGA6P23229 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
ITGA6P23229 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
ITGA6P23229 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
ITGA6P23229 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
ITGA6P23229 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
ITGA6P23229 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
ITGA6P23229 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
ITGA6P23229 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
ITGA6P23229 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
ITGA6P23229 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
ITGA6P23229 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
ITGA6P23229 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
ITGA6P23229 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
ITGA6P23229 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC30.78■■■□□ 2.52
ITGA6P23229 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
ITGA6P23229 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
ITGA6P23229 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
ITGA6P23229 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
ITGA6P23229 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
ITGA6P23229 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
ITGA6P23229 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
ITGA6P23229 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.52
ITGA6P23229 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
ITGA6P23229 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
ITGA6P23229 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC30.76■■■□□ 2.51
ITGA6P23229 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
ITGA6P23229 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
ITGA6P23229 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
ITGA6P23229 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
ITGA6P23229 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
ITGA6P23229 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
ITGA6P23229 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
ITGA6P23229 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
ITGA6P23229 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
ITGA6P23229 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
ITGA6P23229 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
ITGA6P23229 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
ITGA6P23229 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
ITGA6P23229 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
ITGA6P23229 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
ITGA6P23229 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
ITGA6P23229 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
ITGA6P23229 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
ITGA6P23229 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
ITGA6P23229 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
ITGA6P23229 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
ITGA6P23229 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
ITGA6P23229 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
ITGA6P23229 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
ITGA6P23229 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
ITGA6P23229 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
ITGA6P23229 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
ITGA6P23229 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
ITGA6P23229 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
ITGA6P23229 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
ITGA6P23229 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
ITGA6P23229 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
ITGA6P23229 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
ITGA6P23229 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
ITGA6P23229 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
ITGA6P23229 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
ITGA6P23229 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
ITGA6P23229 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
ITGA6P23229 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
ITGA6P23229 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC30.66■■■□□ 2.5
ITGA6P23229 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
ITGA6P23229 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
ITGA6P23229 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.65■■■□□ 2.5
ITGA6P23229 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
ITGA6P23229 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
ITGA6P23229 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
ITGA6P23229 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
ITGA6P23229 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC30.64■■■□□ 2.5
ITGA6P23229 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
ITGA6P23229 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.49
ITGA6P23229 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
ITGA6P23229 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
ITGA6P23229 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
ITGA6P23229 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
ITGA6P23229 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms