Protein–RNA interactions for Protein: P22612

PRKACG, cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKACGP22612 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKACGP22612 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKACGP22612 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRKACGP22612 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRKACGP22612 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRKACGP22612 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRKACGP22612 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRKACGP22612 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PRKACGP22612 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRKACGP22612 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRKACGP22612 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRKACGP22612 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRKACGP22612 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRKACGP22612 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRKACGP22612 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRKACGP22612 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRKACGP22612 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRKACGP22612 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRKACGP22612 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRKACGP22612 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRKACGP22612 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRKACGP22612 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRKACGP22612 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRKACGP22612 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRKACGP22612 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRKACGP22612 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRKACGP22612 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRKACGP22612 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PRKACGP22612 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRKACGP22612 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRKACGP22612 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRKACGP22612 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRKACGP22612 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRKACGP22612 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRKACGP22612 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRKACGP22612 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRKACGP22612 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PRKACGP22612 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRKACGP22612 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PRKACGP22612 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRKACGP22612 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PRKACGP22612 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRKACGP22612 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRKACGP22612 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRKACGP22612 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRKACGP22612 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRKACGP22612 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKACGP22612 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKACGP22612 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKACGP22612 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKACGP22612 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PRKACGP22612 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PRKACGP22612 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRKACGP22612 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRKACGP22612 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRKACGP22612 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRKACGP22612 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRKACGP22612 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRKACGP22612 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRKACGP22612 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRKACGP22612 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRKACGP22612 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRKACGP22612 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRKACGP22612 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRKACGP22612 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRKACGP22612 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRKACGP22612 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRKACGP22612 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRKACGP22612 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRKACGP22612 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRKACGP22612 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRKACGP22612 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRKACGP22612 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRKACGP22612 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRKACGP22612 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRKACGP22612 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRKACGP22612 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRKACGP22612 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRKACGP22612 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRKACGP22612 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRKACGP22612 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRKACGP22612 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRKACGP22612 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRKACGP22612 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRKACGP22612 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PRKACGP22612 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PRKACGP22612 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRKACGP22612 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRKACGP22612 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRKACGP22612 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRKACGP22612 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRKACGP22612 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRKACGP22612 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRKACGP22612 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRKACGP22612 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRKACGP22612 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRKACGP22612 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRKACGP22612 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PRKACGP22612 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRKACGP22612 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms