Protein–RNA interactions for Protein: P21291

CSRP1, Cysteine and glycine-rich protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP1P21291 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CSRP1P21291 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CSRP1P21291 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CSRP1P21291 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CSRP1P21291 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CSRP1P21291 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CSRP1P21291 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CSRP1P21291 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CSRP1P21291 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CSRP1P21291 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CSRP1P21291 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CSRP1P21291 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CSRP1P21291 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CSRP1P21291 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CSRP1P21291 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CSRP1P21291 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CSRP1P21291 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CSRP1P21291 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CSRP1P21291 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CSRP1P21291 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CSRP1P21291 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CSRP1P21291 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CSRP1P21291 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CSRP1P21291 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CSRP1P21291 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CSRP1P21291 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CSRP1P21291 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CSRP1P21291 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CSRP1P21291 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CSRP1P21291 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CSRP1P21291 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CSRP1P21291 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CSRP1P21291 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CSRP1P21291 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CSRP1P21291 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CSRP1P21291 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CSRP1P21291 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CSRP1P21291 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CSRP1P21291 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CSRP1P21291 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CSRP1P21291 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CSRP1P21291 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CSRP1P21291 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CSRP1P21291 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CSRP1P21291 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CSRP1P21291 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSRP1P21291 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CSRP1P21291 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSRP1P21291 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSRP1P21291 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSRP1P21291 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSRP1P21291 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CSRP1P21291 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CSRP1P21291 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CSRP1P21291 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CSRP1P21291 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSRP1P21291 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSRP1P21291 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSRP1P21291 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSRP1P21291 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSRP1P21291 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSRP1P21291 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSRP1P21291 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSRP1P21291 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSRP1P21291 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSRP1P21291 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSRP1P21291 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSRP1P21291 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSRP1P21291 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSRP1P21291 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSRP1P21291 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CSRP1P21291 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSRP1P21291 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSRP1P21291 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSRP1P21291 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSRP1P21291 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSRP1P21291 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CSRP1P21291 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CSRP1P21291 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CSRP1P21291 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CSRP1P21291 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSRP1P21291 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSRP1P21291 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSRP1P21291 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSRP1P21291 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CSRP1P21291 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSRP1P21291 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSRP1P21291 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSRP1P21291 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSRP1P21291 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSRP1P21291 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSRP1P21291 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CSRP1P21291 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSRP1P21291 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSRP1P21291 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSRP1P21291 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSRP1P21291 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CSRP1P21291 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSRP1P21291 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CSRP1P21291 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 167.3 ms