Protein–RNA interactions for Protein: P20719

HOXA5, Homeobox protein Hox-A5, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA5P20719 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA5P20719 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA5P20719 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA5P20719 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA5P20719 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA5P20719 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA5P20719 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA5P20719 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA5P20719 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA5P20719 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA5P20719 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA5P20719 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA5P20719 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA5P20719 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA5P20719 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA5P20719 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA5P20719 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA5P20719 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA5P20719 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA5P20719 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA5P20719 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA5P20719 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA5P20719 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA5P20719 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA5P20719 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA5P20719 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA5P20719 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HOXA5P20719 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXA5P20719 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXA5P20719 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXA5P20719 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXA5P20719 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXA5P20719 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXA5P20719 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXA5P20719 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXA5P20719 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA5P20719 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA5P20719 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA5P20719 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA5P20719 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXA5P20719 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXA5P20719 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXA5P20719 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXA5P20719 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXA5P20719 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXA5P20719 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXA5P20719 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXA5P20719 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXA5P20719 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXA5P20719 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXA5P20719 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXA5P20719 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXA5P20719 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXA5P20719 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXA5P20719 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXA5P20719 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXA5P20719 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXA5P20719 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXA5P20719 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXA5P20719 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXA5P20719 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXA5P20719 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXA5P20719 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXA5P20719 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXA5P20719 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXA5P20719 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXA5P20719 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXA5P20719 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXA5P20719 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXA5P20719 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXA5P20719 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXA5P20719 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXA5P20719 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXA5P20719 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXA5P20719 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXA5P20719 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
HOXA5P20719 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
HOXA5P20719 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA5P20719 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA5P20719 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA5P20719 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA5P20719 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA5P20719 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA5P20719 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXA5P20719 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXA5P20719 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXA5P20719 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXA5P20719 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXA5P20719 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXA5P20719 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXA5P20719 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXA5P20719 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXA5P20719 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXA5P20719 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXA5P20719 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXA5P20719 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXA5P20719 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXA5P20719 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXA5P20719 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXA5P20719 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms