Protein–RNA interactions for Protein: P20340

RAB6A, Ras-related protein Rab-6A, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6AP20340 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAB6AP20340 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAB6AP20340 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAB6AP20340 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB6AP20340 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB6AP20340 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB6AP20340 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB6AP20340 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB6AP20340 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB6AP20340 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB6AP20340 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB6AP20340 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB6AP20340 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB6AP20340 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB6AP20340 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB6AP20340 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB6AP20340 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB6AP20340 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB6AP20340 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB6AP20340 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB6AP20340 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB6AP20340 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB6AP20340 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB6AP20340 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB6AP20340 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAB6AP20340 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAB6AP20340 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAB6AP20340 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAB6AP20340 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAB6AP20340 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAB6AP20340 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAB6AP20340 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RAB6AP20340 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RAB6AP20340 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RAB6AP20340 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RAB6AP20340 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RAB6AP20340 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RAB6AP20340 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
RAB6AP20340 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RAB6AP20340 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
RAB6AP20340 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RAB6AP20340 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAB6AP20340 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAB6AP20340 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAB6AP20340 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAB6AP20340 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAB6AP20340 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
RAB6AP20340 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
RAB6AP20340 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAB6AP20340 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAB6AP20340 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAB6AP20340 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAB6AP20340 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RAB6AP20340 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RAB6AP20340 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RAB6AP20340 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RAB6AP20340 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RAB6AP20340 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RAB6AP20340 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RAB6AP20340 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAB6AP20340 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAB6AP20340 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAB6AP20340 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
RAB6AP20340 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAB6AP20340 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAB6AP20340 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAB6AP20340 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAB6AP20340 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAB6AP20340 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAB6AP20340 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAB6AP20340 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAB6AP20340 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAB6AP20340 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
RAB6AP20340 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAB6AP20340 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAB6AP20340 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAB6AP20340 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAB6AP20340 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RAB6AP20340 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RAB6AP20340 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RAB6AP20340 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RAB6AP20340 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RAB6AP20340 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RAB6AP20340 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
RAB6AP20340 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RAB6AP20340 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RAB6AP20340 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RAB6AP20340 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RAB6AP20340 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RAB6AP20340 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
RAB6AP20340 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAB6AP20340 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAB6AP20340 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAB6AP20340 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAB6AP20340 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAB6AP20340 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAB6AP20340 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAB6AP20340 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAB6AP20340 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAB6AP20340 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms