Protein–RNA interactions for Protein: P20333

TNFRSF1B, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF1BP20333 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TNFRSF1BP20333 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TNFRSF1BP20333 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TNFRSF1BP20333 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNFRSF1BP20333 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNFRSF1BP20333 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNFRSF1BP20333 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNFRSF1BP20333 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNFRSF1BP20333 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNFRSF1BP20333 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNFRSF1BP20333 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNFRSF1BP20333 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNFRSF1BP20333 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNFRSF1BP20333 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNFRSF1BP20333 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNFRSF1BP20333 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TNFRSF1BP20333 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNFRSF1BP20333 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNFRSF1BP20333 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNFRSF1BP20333 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TNFRSF1BP20333 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNFRSF1BP20333 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNFRSF1BP20333 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNFRSF1BP20333 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNFRSF1BP20333 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNFRSF1BP20333 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNFRSF1BP20333 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNFRSF1BP20333 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNFRSF1BP20333 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNFRSF1BP20333 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNFRSF1BP20333 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNFRSF1BP20333 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNFRSF1BP20333 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNFRSF1BP20333 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNFRSF1BP20333 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNFRSF1BP20333 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNFRSF1BP20333 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNFRSF1BP20333 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNFRSF1BP20333 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNFRSF1BP20333 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNFRSF1BP20333 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNFRSF1BP20333 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNFRSF1BP20333 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNFRSF1BP20333 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNFRSF1BP20333 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNFRSF1BP20333 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNFRSF1BP20333 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TNFRSF1BP20333 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TNFRSF1BP20333 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNFRSF1BP20333 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNFRSF1BP20333 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNFRSF1BP20333 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNFRSF1BP20333 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TNFRSF1BP20333 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNFRSF1BP20333 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNFRSF1BP20333 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNFRSF1BP20333 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNFRSF1BP20333 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNFRSF1BP20333 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNFRSF1BP20333 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNFRSF1BP20333 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNFRSF1BP20333 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNFRSF1BP20333 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNFRSF1BP20333 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNFRSF1BP20333 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNFRSF1BP20333 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNFRSF1BP20333 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNFRSF1BP20333 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNFRSF1BP20333 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNFRSF1BP20333 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNFRSF1BP20333 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNFRSF1BP20333 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNFRSF1BP20333 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNFRSF1BP20333 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNFRSF1BP20333 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNFRSF1BP20333 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNFRSF1BP20333 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNFRSF1BP20333 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNFRSF1BP20333 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNFRSF1BP20333 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNFRSF1BP20333 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNFRSF1BP20333 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNFRSF1BP20333 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNFRSF1BP20333 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNFRSF1BP20333 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNFRSF1BP20333 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNFRSF1BP20333 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNFRSF1BP20333 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNFRSF1BP20333 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNFRSF1BP20333 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFRSF1BP20333 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFRSF1BP20333 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFRSF1BP20333 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFRSF1BP20333 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFRSF1BP20333 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFRSF1BP20333 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNFRSF1BP20333 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNFRSF1BP20333 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNFRSF1BP20333 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TNFRSF1BP20333 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms