Protein–RNA interactions for Protein: P17050

NAGA, Alpha-N-acetylgalactosaminidase, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAGAP17050 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NAGAP17050 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NAGAP17050 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NAGAP17050 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NAGAP17050 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NAGAP17050 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NAGAP17050 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NAGAP17050 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NAGAP17050 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NAGAP17050 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NAGAP17050 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NAGAP17050 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NAGAP17050 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NAGAP17050 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NAGAP17050 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NAGAP17050 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NAGAP17050 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NAGAP17050 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NAGAP17050 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NAGAP17050 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NAGAP17050 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NAGAP17050 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NAGAP17050 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NAGAP17050 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NAGAP17050 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NAGAP17050 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NAGAP17050 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NAGAP17050 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NAGAP17050 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NAGAP17050 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NAGAP17050 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NAGAP17050 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NAGAP17050 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NAGAP17050 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NAGAP17050 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NAGAP17050 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NAGAP17050 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NAGAP17050 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NAGAP17050 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NAGAP17050 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NAGAP17050 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NAGAP17050 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NAGAP17050 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NAGAP17050 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NAGAP17050 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NAGAP17050 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NAGAP17050 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NAGAP17050 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NAGAP17050 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
NAGAP17050 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NAGAP17050 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NAGAP17050 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NAGAP17050 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NAGAP17050 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NAGAP17050 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NAGAP17050 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NAGAP17050 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NAGAP17050 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NAGAP17050 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NAGAP17050 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NAGAP17050 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NAGAP17050 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NAGAP17050 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NAGAP17050 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NAGAP17050 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NAGAP17050 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NAGAP17050 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NAGAP17050 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NAGAP17050 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NAGAP17050 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NAGAP17050 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NAGAP17050 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NAGAP17050 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NAGAP17050 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NAGAP17050 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NAGAP17050 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NAGAP17050 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NAGAP17050 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NAGAP17050 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NAGAP17050 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NAGAP17050 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NAGAP17050 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NAGAP17050 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NAGAP17050 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NAGAP17050 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NAGAP17050 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NAGAP17050 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NAGAP17050 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NAGAP17050 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NAGAP17050 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NAGAP17050 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NAGAP17050 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NAGAP17050 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NAGAP17050 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NAGAP17050 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NAGAP17050 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NAGAP17050 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NAGAP17050 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NAGAP17050 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NAGAP17050 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms