Protein–RNA interactions for Protein: P17036

ZNF3, Zinc finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF3P17036 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF3P17036 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF3P17036 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF3P17036 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF3P17036 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF3P17036 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF3P17036 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF3P17036 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF3P17036 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF3P17036 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF3P17036 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF3P17036 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF3P17036 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF3P17036 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF3P17036 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF3P17036 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZNF3P17036 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZNF3P17036 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF3P17036 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF3P17036 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF3P17036 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF3P17036 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF3P17036 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF3P17036 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF3P17036 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF3P17036 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF3P17036 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF3P17036 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF3P17036 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF3P17036 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF3P17036 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF3P17036 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF3P17036 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF3P17036 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF3P17036 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF3P17036 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF3P17036 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF3P17036 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF3P17036 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF3P17036 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF3P17036 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF3P17036 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF3P17036 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF3P17036 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF3P17036 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF3P17036 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF3P17036 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF3P17036 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF3P17036 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF3P17036 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF3P17036 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF3P17036 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF3P17036 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF3P17036 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF3P17036 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF3P17036 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF3P17036 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF3P17036 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF3P17036 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF3P17036 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNF3P17036 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF3P17036 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF3P17036 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF3P17036 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF3P17036 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF3P17036 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF3P17036 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF3P17036 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF3P17036 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF3P17036 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF3P17036 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF3P17036 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF3P17036 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF3P17036 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF3P17036 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF3P17036 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF3P17036 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF3P17036 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF3P17036 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF3P17036 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF3P17036 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF3P17036 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF3P17036 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF3P17036 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF3P17036 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF3P17036 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF3P17036 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF3P17036 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF3P17036 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF3P17036 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF3P17036 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF3P17036 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF3P17036 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF3P17036 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF3P17036 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF3P17036 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF3P17036 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ZNF3P17036 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ZNF3P17036 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ZNF3P17036 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms