Protein–RNA interactions for Protein: P16104

H2AFX, Histone H2AX, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFXP16104 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
H2AFXP16104 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
H2AFXP16104 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
H2AFXP16104 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
H2AFXP16104 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
H2AFXP16104 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
H2AFXP16104 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
H2AFXP16104 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
H2AFXP16104 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
H2AFXP16104 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
H2AFXP16104 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
H2AFXP16104 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
H2AFXP16104 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
H2AFXP16104 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
H2AFXP16104 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
H2AFXP16104 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
H2AFXP16104 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
H2AFXP16104 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
H2AFXP16104 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
H2AFXP16104 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
H2AFXP16104 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
H2AFXP16104 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
H2AFXP16104 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
H2AFXP16104 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
H2AFXP16104 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
H2AFXP16104 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
H2AFXP16104 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
H2AFXP16104 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
H2AFXP16104 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
H2AFXP16104 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
H2AFXP16104 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
H2AFXP16104 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
H2AFXP16104 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
H2AFXP16104 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
H2AFXP16104 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
H2AFXP16104 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
H2AFXP16104 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
H2AFXP16104 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
H2AFXP16104 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
H2AFXP16104 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
H2AFXP16104 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
H2AFXP16104 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
H2AFXP16104 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
H2AFXP16104 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
H2AFXP16104 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
H2AFXP16104 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
H2AFXP16104 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
H2AFXP16104 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
H2AFXP16104 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
H2AFXP16104 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
H2AFXP16104 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
H2AFXP16104 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
H2AFXP16104 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
H2AFXP16104 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
H2AFXP16104 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
H2AFXP16104 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
H2AFXP16104 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
H2AFXP16104 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
H2AFXP16104 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
H2AFXP16104 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
H2AFXP16104 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
H2AFXP16104 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
H2AFXP16104 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
H2AFXP16104 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
H2AFXP16104 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
H2AFXP16104 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
H2AFXP16104 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
H2AFXP16104 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
H2AFXP16104 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
H2AFXP16104 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
H2AFXP16104 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
H2AFXP16104 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
H2AFXP16104 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
H2AFXP16104 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
H2AFXP16104 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
H2AFXP16104 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
H2AFXP16104 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
H2AFXP16104 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
H2AFXP16104 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
H2AFXP16104 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
H2AFXP16104 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
H2AFXP16104 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
H2AFXP16104 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
H2AFXP16104 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
H2AFXP16104 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
H2AFXP16104 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
H2AFXP16104 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
H2AFXP16104 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
H2AFXP16104 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
H2AFXP16104 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
H2AFXP16104 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
H2AFXP16104 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
H2AFXP16104 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
H2AFXP16104 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
H2AFXP16104 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
H2AFXP16104 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
H2AFXP16104 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
H2AFXP16104 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
H2AFXP16104 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
H2AFXP16104 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms