Protein–RNA interactions for Protein: P15924

DSP, Desmoplakin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSPP15924 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DSPP15924 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DSPP15924 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DSPP15924 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DSPP15924 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
DSPP15924 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DSPP15924 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DSPP15924 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DSPP15924 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DSPP15924 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DSPP15924 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DSPP15924 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DSPP15924 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DSPP15924 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DSPP15924 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DSPP15924 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DSPP15924 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
DSPP15924 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DSPP15924 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DSPP15924 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DSPP15924 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DSPP15924 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DSPP15924 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DSPP15924 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
DSPP15924 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
DSPP15924 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DSPP15924 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DSPP15924 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DSPP15924 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DSPP15924 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DSPP15924 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DSPP15924 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DSPP15924 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
DSPP15924 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DSPP15924 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DSPP15924 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DSPP15924 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DSPP15924 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DSPP15924 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DSPP15924 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DSPP15924 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DSPP15924 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DSPP15924 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DSPP15924 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DSPP15924 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
DSPP15924 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DSPP15924 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DSPP15924 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DSPP15924 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DSPP15924 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DSPP15924 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DSPP15924 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
DSPP15924 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DSPP15924 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DSPP15924 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
DSPP15924 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
DSPP15924 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
DSPP15924 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
DSPP15924 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
DSPP15924 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DSPP15924 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
DSPP15924 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DSPP15924 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DSPP15924 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DSPP15924 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DSPP15924 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DSPP15924 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DSPP15924 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
DSPP15924 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
DSPP15924 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DSPP15924 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DSPP15924 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DSPP15924 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DSPP15924 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DSPP15924 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DSPP15924 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DSPP15924 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DSPP15924 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DSPP15924 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DSPP15924 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DSPP15924 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DSPP15924 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DSPP15924 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DSPP15924 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DSPP15924 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DSPP15924 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DSPP15924 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DSPP15924 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DSPP15924 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DSPP15924 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
DSPP15924 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DSPP15924 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DSPP15924 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
DSPP15924 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
DSPP15924 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DSPP15924 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DSPP15924 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DSPP15924 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DSPP15924 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DSPP15924 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms