Protein–RNA interactions for Protein: P13646

KRT13, Keratin, type I cytoskeletal 13, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT13P13646 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KRT13P13646 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KRT13P13646 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KRT13P13646 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KRT13P13646 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KRT13P13646 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KRT13P13646 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KRT13P13646 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KRT13P13646 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
KRT13P13646 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KRT13P13646 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KRT13P13646 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
KRT13P13646 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
KRT13P13646 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KRT13P13646 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KRT13P13646 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KRT13P13646 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KRT13P13646 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KRT13P13646 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KRT13P13646 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KRT13P13646 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KRT13P13646 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
KRT13P13646 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
KRT13P13646 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KRT13P13646 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
KRT13P13646 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
KRT13P13646 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
KRT13P13646 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
KRT13P13646 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
KRT13P13646 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KRT13P13646 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KRT13P13646 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KRT13P13646 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KRT13P13646 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
KRT13P13646 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
KRT13P13646 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
KRT13P13646 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KRT13P13646 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KRT13P13646 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
KRT13P13646 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
KRT13P13646 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
KRT13P13646 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KRT13P13646 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KRT13P13646 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KRT13P13646 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KRT13P13646 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KRT13P13646 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KRT13P13646 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
KRT13P13646 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
KRT13P13646 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KRT13P13646 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
KRT13P13646 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
KRT13P13646 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
KRT13P13646 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
KRT13P13646 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
KRT13P13646 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
KRT13P13646 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
KRT13P13646 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KRT13P13646 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KRT13P13646 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
KRT13P13646 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
KRT13P13646 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
KRT13P13646 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KRT13P13646 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KRT13P13646 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
KRT13P13646 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KRT13P13646 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KRT13P13646 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KRT13P13646 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KRT13P13646 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KRT13P13646 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KRT13P13646 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KRT13P13646 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KRT13P13646 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KRT13P13646 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KRT13P13646 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KRT13P13646 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KRT13P13646 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KRT13P13646 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KRT13P13646 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KRT13P13646 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KRT13P13646 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KRT13P13646 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KRT13P13646 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KRT13P13646 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KRT13P13646 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KRT13P13646 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KRT13P13646 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KRT13P13646 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KRT13P13646 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KRT13P13646 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KRT13P13646 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
KRT13P13646 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
KRT13P13646 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
KRT13P13646 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KRT13P13646 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KRT13P13646 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KRT13P13646 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KRT13P13646 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KRT13P13646 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms