Protein–RNA interactions for Protein: P13500

CCL2, C-C motif chemokine 2, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL2P13500 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCL2P13500 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCL2P13500 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCL2P13500 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCL2P13500 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CCL2P13500 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCL2P13500 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCL2P13500 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCL2P13500 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CCL2P13500 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCL2P13500 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCL2P13500 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCL2P13500 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCL2P13500 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCL2P13500 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCL2P13500 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCL2P13500 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCL2P13500 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCL2P13500 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCL2P13500 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CCL2P13500 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCL2P13500 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCL2P13500 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCL2P13500 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCL2P13500 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCL2P13500 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CCL2P13500 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCL2P13500 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCL2P13500 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCL2P13500 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCL2P13500 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCL2P13500 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCL2P13500 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCL2P13500 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCL2P13500 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCL2P13500 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCL2P13500 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCL2P13500 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCL2P13500 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCL2P13500 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCL2P13500 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCL2P13500 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCL2P13500 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCL2P13500 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCL2P13500 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCL2P13500 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCL2P13500 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCL2P13500 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCL2P13500 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCL2P13500 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCL2P13500 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCL2P13500 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCL2P13500 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCL2P13500 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCL2P13500 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCL2P13500 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CCL2P13500 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCL2P13500 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCL2P13500 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCL2P13500 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CCL2P13500 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCL2P13500 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCL2P13500 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCL2P13500 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CCL2P13500 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCL2P13500 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCL2P13500 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCL2P13500 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCL2P13500 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCL2P13500 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCL2P13500 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCL2P13500 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CCL2P13500 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCL2P13500 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCL2P13500 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCL2P13500 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCL2P13500 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CCL2P13500 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCL2P13500 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCL2P13500 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCL2P13500 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCL2P13500 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCL2P13500 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCL2P13500 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CCL2P13500 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCL2P13500 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCL2P13500 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCL2P13500 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCL2P13500 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCL2P13500 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCL2P13500 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCL2P13500 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCL2P13500 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCL2P13500 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCL2P13500 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCL2P13500 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCL2P13500 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCL2P13500 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCL2P13500 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCL2P13500 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms