Protein–RNA interactions for Protein: P12035

KRT3, Keratin, type II cytoskeletal 3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT3P12035 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KRT3P12035 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KRT3P12035 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KRT3P12035 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KRT3P12035 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KRT3P12035 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KRT3P12035 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KRT3P12035 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KRT3P12035 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
KRT3P12035 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KRT3P12035 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KRT3P12035 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KRT3P12035 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KRT3P12035 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KRT3P12035 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT3P12035 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT3P12035 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT3P12035 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT3P12035 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KRT3P12035 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KRT3P12035 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KRT3P12035 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KRT3P12035 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KRT3P12035 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KRT3P12035 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KRT3P12035 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KRT3P12035 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KRT3P12035 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KRT3P12035 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
KRT3P12035 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KRT3P12035 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KRT3P12035 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KRT3P12035 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KRT3P12035 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KRT3P12035 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
KRT3P12035 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
KRT3P12035 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
KRT3P12035 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KRT3P12035 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KRT3P12035 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KRT3P12035 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KRT3P12035 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KRT3P12035 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KRT3P12035 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KRT3P12035 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KRT3P12035 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KRT3P12035 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KRT3P12035 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KRT3P12035 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KRT3P12035 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KRT3P12035 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KRT3P12035 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KRT3P12035 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
KRT3P12035 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KRT3P12035 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KRT3P12035 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KRT3P12035 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KRT3P12035 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
KRT3P12035 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KRT3P12035 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KRT3P12035 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KRT3P12035 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KRT3P12035 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KRT3P12035 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
KRT3P12035 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KRT3P12035 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
KRT3P12035 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KRT3P12035 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KRT3P12035 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KRT3P12035 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KRT3P12035 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KRT3P12035 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KRT3P12035 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KRT3P12035 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KRT3P12035 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KRT3P12035 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KRT3P12035 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KRT3P12035 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KRT3P12035 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KRT3P12035 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KRT3P12035 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KRT3P12035 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KRT3P12035 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
KRT3P12035 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
KRT3P12035 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KRT3P12035 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KRT3P12035 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
KRT3P12035 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KRT3P12035 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KRT3P12035 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KRT3P12035 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
KRT3P12035 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
KRT3P12035 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KRT3P12035 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KRT3P12035 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KRT3P12035 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KRT3P12035 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KRT3P12035 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KRT3P12035 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KRT3P12035 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms