Protein–RNA interactions for Protein: P11831

SRF, Serum response factor, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRFP11831 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SRFP11831 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SRFP11831 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SRFP11831 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SRFP11831 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SRFP11831 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SRFP11831 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SRFP11831 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SRFP11831 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SRFP11831 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SRFP11831 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SRFP11831 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SRFP11831 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SRFP11831 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SRFP11831 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SRFP11831 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SRFP11831 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SRFP11831 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SRFP11831 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SRFP11831 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SRFP11831 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SRFP11831 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SRFP11831 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SRFP11831 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SRFP11831 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SRFP11831 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SRFP11831 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SRFP11831 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SRFP11831 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SRFP11831 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SRFP11831 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SRFP11831 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SRFP11831 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SRFP11831 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SRFP11831 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SRFP11831 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SRFP11831 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SRFP11831 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SRFP11831 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SRFP11831 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SRFP11831 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SRFP11831 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SRFP11831 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SRFP11831 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SRFP11831 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SRFP11831 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SRFP11831 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SRFP11831 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SRFP11831 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SRFP11831 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SRFP11831 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SRFP11831 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SRFP11831 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SRFP11831 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SRFP11831 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SRFP11831 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SRFP11831 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SRFP11831 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SRFP11831 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SRFP11831 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SRFP11831 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SRFP11831 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SRFP11831 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SRFP11831 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SRFP11831 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SRFP11831 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SRFP11831 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SRFP11831 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SRFP11831 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SRFP11831 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SRFP11831 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SRFP11831 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SRFP11831 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SRFP11831 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SRFP11831 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SRFP11831 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SRFP11831 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SRFP11831 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SRFP11831 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SRFP11831 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SRFP11831 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SRFP11831 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SRFP11831 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SRFP11831 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SRFP11831 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SRFP11831 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SRFP11831 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SRFP11831 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SRFP11831 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SRFP11831 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SRFP11831 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SRFP11831 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SRFP11831 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SRFP11831 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SRFP11831 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SRFP11831 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SRFP11831 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SRFP11831 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SRFP11831 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SRFP11831 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms