Protein–RNA interactions for Protein: P0DJJ0

SRGAP2C, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 2C, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP2CP0DJJ0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SRGAP2CP0DJJ0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
SRGAP2CP0DJJ0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SRGAP2CP0DJJ0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
SRGAP2CP0DJJ0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SRGAP2CP0DJJ0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SRGAP2CP0DJJ0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SRGAP2CP0DJJ0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SRGAP2CP0DJJ0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SRGAP2CP0DJJ0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
SRGAP2CP0DJJ0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SRGAP2CP0DJJ0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SRGAP2CP0DJJ0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SRGAP2CP0DJJ0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
SRGAP2CP0DJJ0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SRGAP2CP0DJJ0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SRGAP2CP0DJJ0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SRGAP2CP0DJJ0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SRGAP2CP0DJJ0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SRGAP2CP0DJJ0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SRGAP2CP0DJJ0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SRGAP2CP0DJJ0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SRGAP2CP0DJJ0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SRGAP2CP0DJJ0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SRGAP2CP0DJJ0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SRGAP2CP0DJJ0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SRGAP2CP0DJJ0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SRGAP2CP0DJJ0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SRGAP2CP0DJJ0 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SRGAP2CP0DJJ0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SRGAP2CP0DJJ0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SRGAP2CP0DJJ0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SRGAP2CP0DJJ0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SRGAP2CP0DJJ0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SRGAP2CP0DJJ0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SRGAP2CP0DJJ0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SRGAP2CP0DJJ0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SRGAP2CP0DJJ0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
SRGAP2CP0DJJ0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SRGAP2CP0DJJ0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SRGAP2CP0DJJ0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SRGAP2CP0DJJ0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SRGAP2CP0DJJ0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SRGAP2CP0DJJ0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SRGAP2CP0DJJ0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SRGAP2CP0DJJ0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SRGAP2CP0DJJ0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
SRGAP2CP0DJJ0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SRGAP2CP0DJJ0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SRGAP2CP0DJJ0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SRGAP2CP0DJJ0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SRGAP2CP0DJJ0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SRGAP2CP0DJJ0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SRGAP2CP0DJJ0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SRGAP2CP0DJJ0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
SRGAP2CP0DJJ0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SRGAP2CP0DJJ0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SRGAP2CP0DJJ0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SRGAP2CP0DJJ0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SRGAP2CP0DJJ0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SRGAP2CP0DJJ0 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SRGAP2CP0DJJ0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SRGAP2CP0DJJ0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SRGAP2CP0DJJ0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SRGAP2CP0DJJ0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SRGAP2CP0DJJ0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
SRGAP2CP0DJJ0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SRGAP2CP0DJJ0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
SRGAP2CP0DJJ0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SRGAP2CP0DJJ0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SRGAP2CP0DJJ0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SRGAP2CP0DJJ0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SRGAP2CP0DJJ0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
SRGAP2CP0DJJ0 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
SRGAP2CP0DJJ0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SRGAP2CP0DJJ0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SRGAP2CP0DJJ0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SRGAP2CP0DJJ0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SRGAP2CP0DJJ0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SRGAP2CP0DJJ0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
SRGAP2CP0DJJ0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
SRGAP2CP0DJJ0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SRGAP2CP0DJJ0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SRGAP2CP0DJJ0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SRGAP2CP0DJJ0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
SRGAP2CP0DJJ0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SRGAP2CP0DJJ0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SRGAP2CP0DJJ0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SRGAP2CP0DJJ0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SRGAP2CP0DJJ0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SRGAP2CP0DJJ0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SRGAP2CP0DJJ0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SRGAP2CP0DJJ0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SRGAP2CP0DJJ0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SRGAP2CP0DJJ0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SRGAP2CP0DJJ0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SRGAP2CP0DJJ0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
SRGAP2CP0DJJ0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SRGAP2CP0DJJ0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SRGAP2CP0DJJ0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms