Protein–RNA interactions for Protein: P0CF97

FAM200B, Protein FAM200B, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM200BP0CF97 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FAM200BP0CF97 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FAM200BP0CF97 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FAM200BP0CF97 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
FAM200BP0CF97 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
FAM200BP0CF97 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FAM200BP0CF97 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FAM200BP0CF97 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FAM200BP0CF97 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
FAM200BP0CF97 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FAM200BP0CF97 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
FAM200BP0CF97 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
FAM200BP0CF97 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
FAM200BP0CF97 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
FAM200BP0CF97 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
FAM200BP0CF97 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FAM200BP0CF97 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FAM200BP0CF97 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
FAM200BP0CF97 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FAM200BP0CF97 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FAM200BP0CF97 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FAM200BP0CF97 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FAM200BP0CF97 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FAM200BP0CF97 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
FAM200BP0CF97 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FAM200BP0CF97 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
FAM200BP0CF97 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
FAM200BP0CF97 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
FAM200BP0CF97 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FAM200BP0CF97 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FAM200BP0CF97 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FAM200BP0CF97 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FAM200BP0CF97 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
FAM200BP0CF97 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FAM200BP0CF97 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FAM200BP0CF97 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
FAM200BP0CF97 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FAM200BP0CF97 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FAM200BP0CF97 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
FAM200BP0CF97 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
FAM200BP0CF97 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
FAM200BP0CF97 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FAM200BP0CF97 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FAM200BP0CF97 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FAM200BP0CF97 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FAM200BP0CF97 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FAM200BP0CF97 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FAM200BP0CF97 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FAM200BP0CF97 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FAM200BP0CF97 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FAM200BP0CF97 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FAM200BP0CF97 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FAM200BP0CF97 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FAM200BP0CF97 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FAM200BP0CF97 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FAM200BP0CF97 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FAM200BP0CF97 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FAM200BP0CF97 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FAM200BP0CF97 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FAM200BP0CF97 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FAM200BP0CF97 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FAM200BP0CF97 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FAM200BP0CF97 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FAM200BP0CF97 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FAM200BP0CF97 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FAM200BP0CF97 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FAM200BP0CF97 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FAM200BP0CF97 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FAM200BP0CF97 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FAM200BP0CF97 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
FAM200BP0CF97 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FAM200BP0CF97 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FAM200BP0CF97 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FAM200BP0CF97 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
FAM200BP0CF97 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FAM200BP0CF97 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FAM200BP0CF97 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FAM200BP0CF97 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
FAM200BP0CF97 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FAM200BP0CF97 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FAM200BP0CF97 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
FAM200BP0CF97 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FAM200BP0CF97 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FAM200BP0CF97 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FAM200BP0CF97 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FAM200BP0CF97 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FAM200BP0CF97 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FAM200BP0CF97 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FAM200BP0CF97 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FAM200BP0CF97 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
FAM200BP0CF97 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FAM200BP0CF97 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FAM200BP0CF97 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FAM200BP0CF97 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
FAM200BP0CF97 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
FAM200BP0CF97 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FAM200BP0CF97 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FAM200BP0CF97 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FAM200BP0CF97 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
FAM200BP0CF97 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms