Protein–RNA interactions for Protein: P0C221

CCDC175, Coiled-coil domain-containing protein 175, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC175P0C221 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CCDC175P0C221 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
CCDC175P0C221 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC175P0C221 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC175P0C221 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC175P0C221 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC175P0C221 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC175P0C221 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC175P0C221 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC175P0C221 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC175P0C221 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC175P0C221 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC175P0C221 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC175P0C221 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC175P0C221 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC175P0C221 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC175P0C221 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC175P0C221 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC175P0C221 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC175P0C221 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC175P0C221 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC175P0C221 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC175P0C221 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC175P0C221 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC175P0C221 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC175P0C221 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.84
CCDC175P0C221 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC175P0C221 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC175P0C221 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC175P0C221 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC175P0C221 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC175P0C221 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC175P0C221 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC175P0C221 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC175P0C221 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC175P0C221 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC175P0C221 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC175P0C221 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC175P0C221 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC175P0C221 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC175P0C221 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC175P0C221 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC175P0C221 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC175P0C221 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC175P0C221 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC175P0C221 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC175P0C221 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC175P0C221 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC175P0C221 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC175P0C221 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC175P0C221 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC175P0C221 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC175P0C221 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC175P0C221 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC175P0C221 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC175P0C221 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC175P0C221 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC175P0C221 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC175P0C221 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC175P0C221 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC175P0C221 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC175P0C221 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC175P0C221 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC175P0C221 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC175P0C221 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC175P0C221 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC175P0C221 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC175P0C221 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC175P0C221 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC175P0C221 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC175P0C221 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CCDC175P0C221 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC175P0C221 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC175P0C221 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC175P0C221 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC175P0C221 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC175P0C221 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC175P0C221 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC175P0C221 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC175P0C221 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC175P0C221 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC175P0C221 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC175P0C221 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC175P0C221 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC175P0C221 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC175P0C221 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC175P0C221 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC175P0C221 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC175P0C221 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC175P0C221 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC175P0C221 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC175P0C221 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC175P0C221 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC175P0C221 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC175P0C221 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC175P0C221 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC175P0C221 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC175P0C221 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC175P0C221 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC175P0C221 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms