Protein–RNA interactions for Protein: P09884

POLA1, DNA polymerase alpha catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLA1P09884 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.36■■■■■ 4.37
POLA1P09884 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.36■■■■■ 4.37
POLA1P09884 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.36■■■■■ 4.37
POLA1P09884 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.36■■■■■ 4.37
POLA1P09884 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.36■■■■■ 4.37
POLA1P09884 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC42.36■■■■■ 4.37
POLA1P09884 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC42.35■■■■■ 4.37
POLA1P09884 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC42.35■■■■■ 4.37
POLA1P09884 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC42.35■■■■■ 4.37
POLA1P09884 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.34■■■■■ 4.37
POLA1P09884 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC42.34■■■■■ 4.37
POLA1P09884 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC42.33■■■■■ 4.37
POLA1P09884 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC42.33■■■■■ 4.37
POLA1P09884 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC42.33■■■■■ 4.37
POLA1P09884 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC42.32■■■■■ 4.37
POLA1P09884 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC42.32■■■■■ 4.36
POLA1P09884 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC42.31■■■■■ 4.36
POLA1P09884 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC42.31■■■■■ 4.36
POLA1P09884 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
POLA1P09884 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.3■■■■■ 4.36
POLA1P09884 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC42.3■■■■■ 4.36
POLA1P09884 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.3■■■■■ 4.36
POLA1P09884 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC42.3■■■■■ 4.36
POLA1P09884 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC42.3■■■■■ 4.36
POLA1P09884 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC42.29■■■■■ 4.36
POLA1P09884 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
POLA1P09884 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
POLA1P09884 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC42.28■■■■■ 4.36
POLA1P09884 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC42.26■■■■■ 4.36
POLA1P09884 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.26■■■■■ 4.36
POLA1P09884 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.26■■■■■ 4.36
POLA1P09884 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC42.26■■■■■ 4.36
POLA1P09884 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC42.24■■■■■ 4.35
POLA1P09884 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.24■■■■■ 4.35
POLA1P09884 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.24■■■■■ 4.35
POLA1P09884 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.24■■■■■ 4.35
POLA1P09884 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC42.23■■■■■ 4.35
POLA1P09884 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.23■■■■■ 4.35
POLA1P09884 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC42.23■■■■■ 4.35
POLA1P09884 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC42.23■■■■■ 4.35
POLA1P09884 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC42.23■■■■■ 4.35
POLA1P09884 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.23■■■■■ 4.35
POLA1P09884 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC42.23■■■■■ 4.35
POLA1P09884 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.22■■■■■ 4.35
POLA1P09884 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC42.22■■■■■ 4.35
POLA1P09884 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC42.22■■■■■ 4.35
POLA1P09884 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC42.22■■■■■ 4.35
POLA1P09884 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC42.21■■■■■ 4.35
POLA1P09884 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC42.2■■■■■ 4.35
POLA1P09884 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
POLA1P09884 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
POLA1P09884 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
POLA1P09884 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.34
POLA1P09884 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC42.18■■■■■ 4.34
POLA1P09884 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.18■■■■■ 4.34
POLA1P09884 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC42.18■■■■■ 4.34
POLA1P09884 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC42.17■■■■■ 4.34
POLA1P09884 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC42.17■■■■■ 4.34
POLA1P09884 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC42.17■■■■■ 4.34
POLA1P09884 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.17■■■■■ 4.34
POLA1P09884 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.17■■■■■ 4.34
POLA1P09884 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC42.17■■■■■ 4.34
POLA1P09884 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.15■■■■■ 4.34
POLA1P09884 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC42.15■■■■■ 4.34
POLA1P09884 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC42.14■■■■■ 4.34
POLA1P09884 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.14■■■■■ 4.34
POLA1P09884 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC42.14■■■■■ 4.34
POLA1P09884 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.13■■■■■ 4.34
POLA1P09884 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC42.12■■■■■ 4.33
POLA1P09884 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC42.11■■■■■ 4.33
POLA1P09884 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC42.11■■■■■ 4.33
POLA1P09884 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC42.11■■■■■ 4.33
POLA1P09884 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC42.11■■■■■ 4.33
POLA1P09884 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.1■■■■■ 4.33
POLA1P09884 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.1■■■■■ 4.33
POLA1P09884 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.09■■■■■ 4.33
POLA1P09884 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC42.08■■■■■ 4.33
POLA1P09884 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.08■■■■■ 4.33
POLA1P09884 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.33
POLA1P09884 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC42.07■■■■■ 4.33
POLA1P09884 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.06■■■■■ 4.32
POLA1P09884 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC42.06■■■■■ 4.32
POLA1P09884 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
POLA1P09884 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
POLA1P09884 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
POLA1P09884 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
POLA1P09884 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC42.05■■■■■ 4.32
POLA1P09884 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.04■■■■■ 4.32
POLA1P09884 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC42.04■■■■■ 4.32
POLA1P09884 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
POLA1P09884 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC42.02■■■■■ 4.32
POLA1P09884 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.01■■■■■ 4.32
POLA1P09884 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.01■■■■■ 4.32
POLA1P09884 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.01■■■■■ 4.32
POLA1P09884 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.01■■■■■ 4.32
POLA1P09884 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC42.01■■■■■ 4.31
POLA1P09884 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.01■■■■■ 4.31
POLA1P09884 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
POLA1P09884 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC42■■■■■ 4.31
POLA1P09884 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC41.99■■■■■ 4.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms