Protein–RNA interactions for Protein: P09496

CLTA, Clathrin light chain A, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTAP09496 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLTAP09496 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLTAP09496 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CLTAP09496 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLTAP09496 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLTAP09496 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLTAP09496 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLTAP09496 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
CLTAP09496 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLTAP09496 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLTAP09496 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLTAP09496 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CLTAP09496 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CLTAP09496 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CLTAP09496 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CLTAP09496 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CLTAP09496 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CLTAP09496 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CLTAP09496 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLTAP09496 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLTAP09496 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLTAP09496 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLTAP09496 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLTAP09496 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLTAP09496 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLTAP09496 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLTAP09496 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLTAP09496 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CLTAP09496 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CLTAP09496 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CLTAP09496 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CLTAP09496 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CLTAP09496 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CLTAP09496 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CLTAP09496 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CLTAP09496 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CLTAP09496 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CLTAP09496 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CLTAP09496 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CLTAP09496 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CLTAP09496 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CLTAP09496 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CLTAP09496 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CLTAP09496 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CLTAP09496 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CLTAP09496 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CLTAP09496 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CLTAP09496 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CLTAP09496 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CLTAP09496 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CLTAP09496 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CLTAP09496 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CLTAP09496 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CLTAP09496 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CLTAP09496 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CLTAP09496 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CLTAP09496 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CLTAP09496 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CLTAP09496 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CLTAP09496 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CLTAP09496 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CLTAP09496 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CLTAP09496 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CLTAP09496 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CLTAP09496 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CLTAP09496 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CLTAP09496 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CLTAP09496 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CLTAP09496 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CLTAP09496 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CLTAP09496 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CLTAP09496 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CLTAP09496 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CLTAP09496 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CLTAP09496 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CLTAP09496 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CLTAP09496 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CLTAP09496 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CLTAP09496 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CLTAP09496 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CLTAP09496 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CLTAP09496 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CLTAP09496 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CLTAP09496 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CLTAP09496 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CLTAP09496 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CLTAP09496 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CLTAP09496 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CLTAP09496 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CLTAP09496 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CLTAP09496 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLTAP09496 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLTAP09496 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLTAP09496 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLTAP09496 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLTAP09496 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLTAP09496 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLTAP09496 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLTAP09496 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CLTAP09496 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms