Protein–RNA interactions for Protein: P08908

HTR1A, 5-hydroxytryptamine receptor 1A, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR1AP08908 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
HTR1AP08908 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HTR1AP08908 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HTR1AP08908 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HTR1AP08908 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HTR1AP08908 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HTR1AP08908 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HTR1AP08908 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HTR1AP08908 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HTR1AP08908 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HTR1AP08908 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HTR1AP08908 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HTR1AP08908 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HTR1AP08908 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HTR1AP08908 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HTR1AP08908 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HTR1AP08908 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HTR1AP08908 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HTR1AP08908 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HTR1AP08908 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HTR1AP08908 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HTR1AP08908 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HTR1AP08908 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HTR1AP08908 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
HTR1AP08908 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HTR1AP08908 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HTR1AP08908 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HTR1AP08908 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HTR1AP08908 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HTR1AP08908 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HTR1AP08908 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HTR1AP08908 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HTR1AP08908 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HTR1AP08908 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HTR1AP08908 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HTR1AP08908 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HTR1AP08908 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HTR1AP08908 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HTR1AP08908 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HTR1AP08908 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
HTR1AP08908 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HTR1AP08908 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HTR1AP08908 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HTR1AP08908 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HTR1AP08908 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HTR1AP08908 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HTR1AP08908 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HTR1AP08908 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HTR1AP08908 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HTR1AP08908 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HTR1AP08908 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HTR1AP08908 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HTR1AP08908 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HTR1AP08908 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HTR1AP08908 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HTR1AP08908 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HTR1AP08908 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HTR1AP08908 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HTR1AP08908 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HTR1AP08908 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HTR1AP08908 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HTR1AP08908 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HTR1AP08908 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HTR1AP08908 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HTR1AP08908 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HTR1AP08908 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HTR1AP08908 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HTR1AP08908 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HTR1AP08908 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HTR1AP08908 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HTR1AP08908 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HTR1AP08908 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HTR1AP08908 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HTR1AP08908 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HTR1AP08908 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HTR1AP08908 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HTR1AP08908 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HTR1AP08908 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HTR1AP08908 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HTR1AP08908 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HTR1AP08908 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HTR1AP08908 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HTR1AP08908 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HTR1AP08908 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HTR1AP08908 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HTR1AP08908 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HTR1AP08908 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HTR1AP08908 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HTR1AP08908 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HTR1AP08908 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HTR1AP08908 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HTR1AP08908 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HTR1AP08908 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HTR1AP08908 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HTR1AP08908 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HTR1AP08908 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HTR1AP08908 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HTR1AP08908 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HTR1AP08908 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HTR1AP08908 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.3 ms