Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

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Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
PTPRCP08575 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
PTPRCP08575 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
PTPRCP08575 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
PTPRCP08575 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
PTPRCP08575 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
PTPRCP08575 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
PTPRCP08575 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
PTPRCP08575 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
PTPRCP08575 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
PTPRCP08575 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC31.53■■■□□ 2.64
PTPRCP08575 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
PTPRCP08575 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
PTPRCP08575 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
PTPRCP08575 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
PTPRCP08575 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
PTPRCP08575 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
PTPRCP08575 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
PTPRCP08575 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC31.51■■■□□ 2.64
PTPRCP08575 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC31.51■■■□□ 2.64
PTPRCP08575 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
PTPRCP08575 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
PTPRCP08575 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
PTPRCP08575 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
PTPRCP08575 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
PTPRCP08575 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
PTPRCP08575 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
PTPRCP08575 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
PTPRCP08575 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
PTPRCP08575 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
PTPRCP08575 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
PTPRCP08575 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
PTPRCP08575 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
PTPRCP08575 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
PTPRCP08575 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
PTPRCP08575 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
PTPRCP08575 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
PTPRCP08575 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
PTPRCP08575 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
PTPRCP08575 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
PTPRCP08575 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
PTPRCP08575 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
PTPRCP08575 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
PTPRCP08575 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
PTPRCP08575 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
PTPRCP08575 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
PTPRCP08575 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
PTPRCP08575 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
PTPRCP08575 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
PTPRCP08575 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
PTPRCP08575 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
PTPRCP08575 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
PTPRCP08575 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
PTPRCP08575 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC31.42■■■□□ 2.62
PTPRCP08575 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC31.41■■■□□ 2.62
PTPRCP08575 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
PTPRCP08575 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
PTPRCP08575 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
PTPRCP08575 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
PTPRCP08575 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC31.39■■■□□ 2.62
PTPRCP08575 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
PTPRCP08575 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
PTPRCP08575 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
PTPRCP08575 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
PTPRCP08575 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
PTPRCP08575 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
PTPRCP08575 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
PTPRCP08575 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
PTPRCP08575 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
PTPRCP08575 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
PTPRCP08575 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
PTPRCP08575 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
PTPRCP08575 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
PTPRCP08575 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
PTPRCP08575 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
PTPRCP08575 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
PTPRCP08575 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
PTPRCP08575 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
PTPRCP08575 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
PTPRCP08575 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
PTPRCP08575 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
PTPRCP08575 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
PTPRCP08575 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
PTPRCP08575 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
PTPRCP08575 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
PTPRCP08575 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
PTPRCP08575 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
PTPRCP08575 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
PTPRCP08575 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC31.32■■■□□ 2.6
PTPRCP08575 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
PTPRCP08575 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC31.31■■■□□ 2.6
PTPRCP08575 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
PTPRCP08575 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
PTPRCP08575 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
PTPRCP08575 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
PTPRCP08575 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
PTPRCP08575 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC31.3■■■□□ 2.6
PTPRCP08575 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
PTPRCP08575 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
PTPRCP08575 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
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