Protein–RNA interactions for Protein: P07358

C8B, Complement component C8 beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8BP07358 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C8BP07358 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C8BP07358 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C8BP07358 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C8BP07358 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C8BP07358 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
C8BP07358 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
C8BP07358 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C8BP07358 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C8BP07358 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C8BP07358 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C8BP07358 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C8BP07358 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C8BP07358 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C8BP07358 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
C8BP07358 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C8BP07358 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C8BP07358 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C8BP07358 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C8BP07358 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
C8BP07358 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C8BP07358 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C8BP07358 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C8BP07358 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
C8BP07358 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C8BP07358 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C8BP07358 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
C8BP07358 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C8BP07358 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C8BP07358 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
C8BP07358 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C8BP07358 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C8BP07358 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C8BP07358 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
C8BP07358 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C8BP07358 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C8BP07358 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C8BP07358 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C8BP07358 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C8BP07358 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
C8BP07358 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
C8BP07358 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
C8BP07358 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
C8BP07358 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C8BP07358 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C8BP07358 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
C8BP07358 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C8BP07358 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C8BP07358 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C8BP07358 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
C8BP07358 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C8BP07358 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C8BP07358 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C8BP07358 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C8BP07358 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C8BP07358 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C8BP07358 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
C8BP07358 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C8BP07358 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C8BP07358 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C8BP07358 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C8BP07358 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C8BP07358 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C8BP07358 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C8BP07358 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C8BP07358 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C8BP07358 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C8BP07358 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
C8BP07358 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C8BP07358 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
C8BP07358 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
C8BP07358 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C8BP07358 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C8BP07358 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C8BP07358 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C8BP07358 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C8BP07358 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C8BP07358 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C8BP07358 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C8BP07358 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C8BP07358 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C8BP07358 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C8BP07358 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C8BP07358 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C8BP07358 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C8BP07358 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C8BP07358 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C8BP07358 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C8BP07358 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C8BP07358 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C8BP07358 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C8BP07358 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C8BP07358 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C8BP07358 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C8BP07358 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C8BP07358 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C8BP07358 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C8BP07358 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C8BP07358 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C8BP07358 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms