Protein–RNA interactions for Protein: P05783

KRT18, Keratin, type I cytoskeletal 18, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT18P05783 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
KRT18P05783 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
KRT18P05783 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KRT18P05783 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KRT18P05783 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KRT18P05783 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
KRT18P05783 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KRT18P05783 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
KRT18P05783 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KRT18P05783 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KRT18P05783 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KRT18P05783 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KRT18P05783 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KRT18P05783 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KRT18P05783 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KRT18P05783 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KRT18P05783 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KRT18P05783 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KRT18P05783 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KRT18P05783 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KRT18P05783 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
KRT18P05783 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
KRT18P05783 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KRT18P05783 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
KRT18P05783 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KRT18P05783 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KRT18P05783 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KRT18P05783 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KRT18P05783 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
KRT18P05783 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KRT18P05783 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KRT18P05783 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KRT18P05783 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KRT18P05783 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KRT18P05783 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KRT18P05783 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.56■■■□□ 2
KRT18P05783 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
KRT18P05783 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KRT18P05783 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
KRT18P05783 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.56■■■□□ 2
KRT18P05783 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KRT18P05783 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
KRT18P05783 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
KRT18P05783 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KRT18P05783 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KRT18P05783 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
KRT18P05783 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.54■■■□□ 2
KRT18P05783 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.54■■■□□ 2
KRT18P05783 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
KRT18P05783 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
KRT18P05783 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
KRT18P05783 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
KRT18P05783 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
KRT18P05783 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KRT18P05783 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
KRT18P05783 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
KRT18P05783 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KRT18P05783 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KRT18P05783 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KRT18P05783 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KRT18P05783 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
KRT18P05783 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KRT18P05783 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KRT18P05783 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KRT18P05783 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KRT18P05783 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KRT18P05783 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KRT18P05783 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KRT18P05783 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KRT18P05783 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KRT18P05783 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KRT18P05783 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KRT18P05783 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KRT18P05783 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KRT18P05783 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KRT18P05783 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KRT18P05783 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KRT18P05783 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KRT18P05783 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KRT18P05783 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KRT18P05783 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KRT18P05783 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KRT18P05783 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KRT18P05783 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KRT18P05783 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KRT18P05783 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
KRT18P05783 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
KRT18P05783 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
KRT18P05783 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
KRT18P05783 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KRT18P05783 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KRT18P05783 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KRT18P05783 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
KRT18P05783 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KRT18P05783 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KRT18P05783 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KRT18P05783 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
KRT18P05783 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
KRT18P05783 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KRT18P05783 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.2 ms