Protein–RNA interactions for Protein: P05549

TFAP2A, Transcription factor AP-2-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAP2AP05549 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TFAP2AP05549 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TFAP2AP05549 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TFAP2AP05549 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TFAP2AP05549 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TFAP2AP05549 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TFAP2AP05549 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TFAP2AP05549 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TFAP2AP05549 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TFAP2AP05549 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TFAP2AP05549 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TFAP2AP05549 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TFAP2AP05549 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TFAP2AP05549 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TFAP2AP05549 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TFAP2AP05549 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TFAP2AP05549 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TFAP2AP05549 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TFAP2AP05549 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TFAP2AP05549 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TFAP2AP05549 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TFAP2AP05549 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TFAP2AP05549 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TFAP2AP05549 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TFAP2AP05549 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TFAP2AP05549 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TFAP2AP05549 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TFAP2AP05549 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TFAP2AP05549 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TFAP2AP05549 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TFAP2AP05549 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TFAP2AP05549 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TFAP2AP05549 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TFAP2AP05549 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TFAP2AP05549 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TFAP2AP05549 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TFAP2AP05549 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TFAP2AP05549 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TFAP2AP05549 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TFAP2AP05549 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TFAP2AP05549 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TFAP2AP05549 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TFAP2AP05549 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TFAP2AP05549 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TFAP2AP05549 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TFAP2AP05549 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TFAP2AP05549 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TFAP2AP05549 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TFAP2AP05549 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TFAP2AP05549 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TFAP2AP05549 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TFAP2AP05549 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TFAP2AP05549 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TFAP2AP05549 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TFAP2AP05549 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TFAP2AP05549 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TFAP2AP05549 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TFAP2AP05549 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TFAP2AP05549 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TFAP2AP05549 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TFAP2AP05549 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TFAP2AP05549 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TFAP2AP05549 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TFAP2AP05549 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TFAP2AP05549 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TFAP2AP05549 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TFAP2AP05549 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TFAP2AP05549 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TFAP2AP05549 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TFAP2AP05549 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TFAP2AP05549 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TFAP2AP05549 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TFAP2AP05549 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TFAP2AP05549 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TFAP2AP05549 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TFAP2AP05549 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TFAP2AP05549 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TFAP2AP05549 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TFAP2AP05549 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TFAP2AP05549 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TFAP2AP05549 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TFAP2AP05549 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TFAP2AP05549 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TFAP2AP05549 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TFAP2AP05549 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TFAP2AP05549 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TFAP2AP05549 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TFAP2AP05549 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TFAP2AP05549 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TFAP2AP05549 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TFAP2AP05549 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TFAP2AP05549 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TFAP2AP05549 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TFAP2AP05549 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TFAP2AP05549 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TFAP2AP05549 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TFAP2AP05549 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TFAP2AP05549 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TFAP2AP05549 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TFAP2AP05549 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms