Protein–RNA interactions for Protein: P05166

PCCB, Propionyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCCBP05166 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCCBP05166 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCCBP05166 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCCBP05166 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCCBP05166 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PCCBP05166 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PCCBP05166 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PCCBP05166 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PCCBP05166 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PCCBP05166 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCCBP05166 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCCBP05166 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCCBP05166 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCCBP05166 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCCBP05166 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PCCBP05166 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCCBP05166 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCCBP05166 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCCBP05166 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PCCBP05166 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCCBP05166 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCCBP05166 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCCBP05166 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCCBP05166 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCCBP05166 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCCBP05166 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCCBP05166 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PCCBP05166 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PCCBP05166 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PCCBP05166 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCCBP05166 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCCBP05166 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCCBP05166 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCCBP05166 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCCBP05166 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCCBP05166 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCCBP05166 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCCBP05166 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PCCBP05166 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCCBP05166 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCCBP05166 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCCBP05166 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCCBP05166 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCCBP05166 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCCBP05166 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCCBP05166 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCCBP05166 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCCBP05166 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PCCBP05166 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCCBP05166 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCCBP05166 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCCBP05166 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCCBP05166 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCCBP05166 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCCBP05166 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCCBP05166 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCCBP05166 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCCBP05166 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCCBP05166 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PCCBP05166 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCCBP05166 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCCBP05166 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCCBP05166 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCCBP05166 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCCBP05166 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PCCBP05166 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PCCBP05166 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCCBP05166 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCCBP05166 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCCBP05166 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCCBP05166 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCCBP05166 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCCBP05166 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PCCBP05166 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCCBP05166 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCCBP05166 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCCBP05166 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PCCBP05166 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCCBP05166 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCCBP05166 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PCCBP05166 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCCBP05166 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCCBP05166 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PCCBP05166 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCCBP05166 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCCBP05166 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCCBP05166 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PCCBP05166 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCCBP05166 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCCBP05166 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCCBP05166 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCCBP05166 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PCCBP05166 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PCCBP05166 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCCBP05166 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCCBP05166 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCCBP05166 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PCCBP05166 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCCBP05166 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCCBP05166 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms