Protein–RNA interactions for Protein: P04150

NR3C1, Glucocorticoid receptor, humanhuman

Predictions only

Length 777 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR3C1P04150 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NR3C1P04150 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NR3C1P04150 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NR3C1P04150 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NR3C1P04150 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NR3C1P04150 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NR3C1P04150 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
NR3C1P04150 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NR3C1P04150 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NR3C1P04150 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NR3C1P04150 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NR3C1P04150 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NR3C1P04150 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NR3C1P04150 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NR3C1P04150 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NR3C1P04150 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NR3C1P04150 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NR3C1P04150 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NR3C1P04150 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NR3C1P04150 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NR3C1P04150 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NR3C1P04150 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NR3C1P04150 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NR3C1P04150 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NR3C1P04150 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NR3C1P04150 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NR3C1P04150 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NR3C1P04150 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NR3C1P04150 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NR3C1P04150 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
NR3C1P04150 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NR3C1P04150 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NR3C1P04150 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NR3C1P04150 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NR3C1P04150 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NR3C1P04150 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NR3C1P04150 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NR3C1P04150 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NR3C1P04150 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NR3C1P04150 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
NR3C1P04150 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NR3C1P04150 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NR3C1P04150 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NR3C1P04150 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NR3C1P04150 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NR3C1P04150 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NR3C1P04150 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NR3C1P04150 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NR3C1P04150 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NR3C1P04150 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NR3C1P04150 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NR3C1P04150 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NR3C1P04150 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NR3C1P04150 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NR3C1P04150 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
NR3C1P04150 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NR3C1P04150 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NR3C1P04150 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NR3C1P04150 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NR3C1P04150 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NR3C1P04150 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NR3C1P04150 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NR3C1P04150 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NR3C1P04150 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
NR3C1P04150 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NR3C1P04150 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NR3C1P04150 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
NR3C1P04150 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
NR3C1P04150 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NR3C1P04150 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NR3C1P04150 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NR3C1P04150 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NR3C1P04150 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NR3C1P04150 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NR3C1P04150 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NR3C1P04150 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NR3C1P04150 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NR3C1P04150 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NR3C1P04150 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NR3C1P04150 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NR3C1P04150 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NR3C1P04150 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NR3C1P04150 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NR3C1P04150 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NR3C1P04150 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NR3C1P04150 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NR3C1P04150 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NR3C1P04150 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NR3C1P04150 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NR3C1P04150 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NR3C1P04150 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NR3C1P04150 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NR3C1P04150 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NR3C1P04150 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NR3C1P04150 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NR3C1P04150 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NR3C1P04150 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
NR3C1P04150 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NR3C1P04150 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NR3C1P04150 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 206 ms