Protein–RNA interactions for Protein: P02730

SLC4A1, Band 3 anion transport protein, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A1P02730 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC4A1P02730 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC4A1P02730 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC4A1P02730 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC4A1P02730 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC4A1P02730 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC4A1P02730 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC4A1P02730 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC4A1P02730 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC4A1P02730 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC4A1P02730 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC4A1P02730 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC4A1P02730 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC4A1P02730 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC4A1P02730 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC4A1P02730 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC4A1P02730 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC4A1P02730 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC4A1P02730 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC4A1P02730 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC4A1P02730 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC4A1P02730 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SLC4A1P02730 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SLC4A1P02730 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC4A1P02730 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC4A1P02730 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC4A1P02730 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC4A1P02730 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC4A1P02730 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC4A1P02730 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC4A1P02730 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC4A1P02730 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC4A1P02730 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC4A1P02730 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC4A1P02730 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC4A1P02730 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC4A1P02730 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC4A1P02730 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC4A1P02730 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC4A1P02730 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC4A1P02730 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC4A1P02730 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC4A1P02730 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC4A1P02730 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC4A1P02730 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC4A1P02730 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC4A1P02730 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC4A1P02730 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC4A1P02730 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC4A1P02730 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC4A1P02730 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC4A1P02730 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC4A1P02730 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC4A1P02730 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC4A1P02730 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC4A1P02730 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC4A1P02730 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC4A1P02730 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC4A1P02730 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC4A1P02730 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC4A1P02730 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLC4A1P02730 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC4A1P02730 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC4A1P02730 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC4A1P02730 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC4A1P02730 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC4A1P02730 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC4A1P02730 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC4A1P02730 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC4A1P02730 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC4A1P02730 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC4A1P02730 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC4A1P02730 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC4A1P02730 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC4A1P02730 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC4A1P02730 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC4A1P02730 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC4A1P02730 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC4A1P02730 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC4A1P02730 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC4A1P02730 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC4A1P02730 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC4A1P02730 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC4A1P02730 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC4A1P02730 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC4A1P02730 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC4A1P02730 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC4A1P02730 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC4A1P02730 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC4A1P02730 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC4A1P02730 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC4A1P02730 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC4A1P02730 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC4A1P02730 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC4A1P02730 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC4A1P02730 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC4A1P02730 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC4A1P02730 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC4A1P02730 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC4A1P02730 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms