Protein–RNA interactions for Protein: P02649

APOE, Apolipoprotein E, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOEP02649 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
APOEP02649 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
APOEP02649 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
APOEP02649 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
APOEP02649 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
APOEP02649 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
APOEP02649 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
APOEP02649 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
APOEP02649 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
APOEP02649 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
APOEP02649 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
APOEP02649 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
APOEP02649 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
APOEP02649 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
APOEP02649 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
APOEP02649 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
APOEP02649 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
APOEP02649 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
APOEP02649 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
APOEP02649 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
APOEP02649 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
APOEP02649 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
APOEP02649 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
APOEP02649 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
APOEP02649 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
APOEP02649 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
APOEP02649 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
APOEP02649 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
APOEP02649 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
APOEP02649 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
APOEP02649 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
APOEP02649 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
APOEP02649 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
APOEP02649 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
APOEP02649 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
APOEP02649 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
APOEP02649 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
APOEP02649 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
APOEP02649 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
APOEP02649 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
APOEP02649 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
APOEP02649 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
APOEP02649 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
APOEP02649 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
APOEP02649 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
APOEP02649 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
APOEP02649 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
APOEP02649 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
APOEP02649 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
APOEP02649 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
APOEP02649 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
APOEP02649 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
APOEP02649 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
APOEP02649 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
APOEP02649 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
APOEP02649 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
APOEP02649 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
APOEP02649 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
APOEP02649 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
APOEP02649 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
APOEP02649 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
APOEP02649 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
APOEP02649 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
APOEP02649 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
APOEP02649 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
APOEP02649 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
APOEP02649 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
APOEP02649 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
APOEP02649 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
APOEP02649 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
APOEP02649 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
APOEP02649 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
APOEP02649 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
APOEP02649 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
APOEP02649 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
APOEP02649 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
APOEP02649 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
APOEP02649 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
APOEP02649 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
APOEP02649 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
APOEP02649 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
APOEP02649 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
APOEP02649 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
APOEP02649 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
APOEP02649 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
APOEP02649 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
APOEP02649 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
APOEP02649 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
APOEP02649 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
APOEP02649 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
APOEP02649 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
APOEP02649 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
APOEP02649 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
APOEP02649 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
APOEP02649 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
APOEP02649 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
APOEP02649 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
APOEP02649 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
APOEP02649 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
APOEP02649 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms